為保存和發(fā)揚傳統(tǒng)文化，元濟(jì)在收集和影印古籍方面也不遺余力。早在辛亥以前，書館就曾組織出版《五經(jīng)備旨》、《左傳》、《讀通鑒論》等十余種典籍。宣統(tǒng)元年（1909年）涵芬樓落成，元濟(jì)集中收購紹興徐氏熔經(jīng)鑄史齋、太倉顧氏諛聞齋、烏程蔣氏密音韻齋和揚州何氏等四大藏書家之藏書。此外，秦漢十印齋、意園、持靜齋等的藏書散出時，涵芬樓亦購得其中善本、精品數(shù)十種。自1915年起，涵芬樓開始收集地方志，至1931年，已有方志二千六百四十余種，其種數(shù)之多，當(dāng)時國內(nèi)外斷無堪與匹敵者也。

與此同時，元濟(jì)還致力于引進(jìn)西學(xué)、介紹新知，精心選擇、組織翻譯出版了一大批外國學(xué)術(shù)和文學(xué)名著，以嚴(yán)復(fù)翻譯的《天演論》、林紓翻譯的《茶花女》影響尤為深遠(yuǎn)。在其主持下，商務(wù)還編輯出版了一大批工具書。1915年，我國第一部新式辭書《辭源》問世，開創(chuàng)了我國現(xiàn)代工具書的出版先河。此外，商務(wù)還編輯出版了十多種在民眾中有廣泛影響的雜志，如《東方雜志》、《小說月報》、《教育雜志》、《婦女雜志》、《學(xué)生雜志》等。

從1916年起，為弘揚國粹，商務(wù)印書館開始影印國內(nèi)外公私收藏善本，1919—1937年間，動用國內(nèi)外五十余家之公私藏書，影印《涵芬樓秘藉》、《續(xù)古逸叢書》、《四部叢刊》、《百衲本二十四史》等珍貴史籍共計610種，近兩萬卷。此番影印工作由元濟(jì)親自主持，其用力之勤，非一般可以想象。元濟(jì)慧眼獨具，選求母本必用善本，以真版石印法，開創(chuàng)古籍叢書翻刻、影印之新階段。特別是《四部叢刊》和《百衲本二十四史》，其版本之精善，?？敝珜彛∷⒅?，堪稱前所未有，至今仍是后世出版行業(yè)之典范。尤其是《百衲本二十四史》，以極高的史料價值、版本價值和收藏價值為后世史家所珍愛，乃惠及史林，功在千秋之壯舉。

在《百衲本二十四史》問世之前，清乾隆皇帝“欽定”的《武英殿本二十四史》（簡稱殿本）是清代和民國初期正史典籍中最為流行的版本。但殿本編纂者皆御用史官，受身份和時代局限，必為朝廷意志所左右，史料記述過程中曲筆錯訛在所難免；加之在?？鄙喜粔?qū)徤?，?？滩痪?，不僅有大量單個文字錯誤，且段落顛倒、整段文字脫奪之情況亦時有發(fā)生，給史學(xué)研究者帶來的不便可想而知。

曾為翰林史官的張元濟(jì)先生深知個中原委，決意重校正史。他匯集善本，重新?？陛嬘∫徊抗疟救罚曰謴?fù)正史原貌，糾正殿本錯謬。自此，商務(wù)印書館傾全館之力，數(shù)十年如一日，秉持“續(xù)古代文化之命，續(xù)民族文化之命”之信條，表現(xiàn)出以拯救優(yōu)秀文化古籍為己任的遠(yuǎn)見與氣魄。元濟(jì)不惜巨資廣搜各史的宋元善本，采用當(dāng)時最先進(jìn)的攝影制版技術(shù)，嘔心瀝血十八寒暑，方大功告成。因《百衲本二十四史》選用的各種版本殘缺不全，乃通過許多版本相互參校、補綴而成，有如僧人的“百衲衣”，故得此名。