雖然，周恩來被繼續(xù)留任，實(shí)際上是處于留職察看的境地，處境十分艱難。

周恩來極力保持住他所領(lǐng)導(dǎo)的中央軍委、特科和交通機(jī)關(guān)，不使王明派人打進(jìn)來。例如王明曾經(jīng)要派一個(gè)黃埔生黃第紅到中央軍委工作，而這個(gè)人實(shí)際上暗中已同蔣介石勾搭上。周恩來通過情報(bào)系統(tǒng)截到了黃第紅給蔣介石的效忠信，拿給王明看，王明才沒有話說。

4月24日，中央特科負(fù)責(zé)人顧順章在漢口被捕叛變。在南京打入國(guó)民黨中央組織部調(diào)查科的共產(chǎn)黨員錢壯飛得知后立即派人報(bào)告中央。周恩來在陳云等協(xié)助下果斷地采取緊急措施，安全轉(zhuǎn)移了中共中央、江蘇省委和共產(chǎn)國(guó)際遠(yuǎn)東局的全部機(jī)構(gòu)，國(guó)民黨企圖一舉破壞中共中央領(lǐng)導(dǎo)機(jī)關(guān)的計(jì)劃落了空。接著，躲住在周恩來寓所的向忠發(fā)，不聽周恩來的勸告，擅自外出，被國(guó)民黨逮捕。周恩來正在設(shè)法營(yíng)救，卻得到消息說向忠發(fā)已經(jīng)叛變。周恩來冒險(xiǎn)到自己的寓所去觀察聯(lián)絡(luò)信號(hào)，斷定向忠發(fā)已經(jīng)帶人來搜查過，趕緊離開。從此，周恩來再難在上海秘密工作下去了。

1931年12月上旬，周恩來離開上海，坐船經(jīng)廣東省的汕頭、大埔，轉(zhuǎn)到福建永定繼續(xù)航行，于下旬到達(dá)江西中央革命根據(jù)地。

這時(shí)，王明已經(jīng)先周恩來于10月間離開上海去了莫斯科。行前，王明曾經(jīng)對(duì)周恩來說，到中央蘇區(qū)后，毛澤東只管政府的工作。周恩來離上海前，中共臨時(shí)中央負(fù)責(zé)人博古又對(duì)周恩來說，到中央蘇區(qū)后，周恩來是蘇區(qū)中央局書記，毛澤東管政府，朱德管軍事。這都是說，不要毛澤東管軍事。

但周恩來到中央蘇區(qū)后，并沒有完全按臨時(shí)中央的指示辦，而是實(shí)事求是地對(duì)待毛澤東的缺點(diǎn)與長(zhǎng)處。

周恩來走馬上任后抓的第一件事就是糾正中央蘇區(qū)肅反擴(kuò)大化的錯(cuò)誤。1932年1月7日，周恩來主持蘇區(qū)中央局通過的《關(guān)于蘇區(qū)肅反工作的決議案》，不僅批評(píng)過去中央局，也批評(píng)毛澤東為首的紅軍總前委犯了“肅反工作中路線錯(cuò)誤”，即擴(kuò)大化的錯(cuò)誤。

50年后鄧小平回憶此事這樣評(píng)價(jià)道：“開始打AB團(tuán)的時(shí)候，毛澤東同志也參加了……在那種異常緊張的戰(zhàn)爭(zhēng)環(huán)境中，內(nèi)部發(fā)現(xiàn)壞人，提高警惕是必要的。但是，腦子發(fā)熱，分析不清，聽到一個(gè)口供就相信了，這樣就難于避免犯錯(cuò)誤。”

鄧小平明確指出毛澤東當(dāng)時(shí)也犯了錯(cuò)誤。周恩來批評(píng)毛澤東的錯(cuò)誤，正表現(xiàn)了他對(duì)黨、對(duì)革命事業(yè)負(fù)責(zé)和實(shí)事求是的精神，絕非像港臺(tái)等作者著述的觀點(diǎn)是周恩來整治毛澤東的開始。毛澤東在工作中有錯(cuò)誤，作為上級(jí)領(lǐng)導(dǎo)的周恩來批評(píng)他是對(duì)的。絕不能把批評(píng)與自我批評(píng)這一黨的優(yōu)良傳統(tǒng)和作風(fēng)，說成是“互相攻擊”。一般認(rèn)為，周恩來在同毛澤東的相互關(guān)系中，主要是崇敬、服從、彌補(bǔ)和相輔相成，這當(dāng)然是對(duì)的。但是，也不能忽略周恩來敢于堅(jiān)持自己的意見，敢于發(fā)表與毛澤東的不同意見，也是有斗爭(zhēng)性和原則性的一面。這一點(diǎn)，無論是毛澤東作為黨的領(lǐng)袖之前還是其后都是如此。20多年后，1956年9月10日，毛澤東本人在中共“八大”預(yù)備會(huì)議第二次全體會(huì)議上，談及往事，對(duì)于中央蘇區(qū)肅AB團(tuán)，說了一句語重心長(zhǎng)的話：“肅反時(shí)我犯了錯(cuò)誤，第一次肅反肅錯(cuò)了人?！?/p>