中世紀以后，笛卡兒和斯賓諾莎繼承亞里士多德的傳統(tǒng)，以形而上學的推理解釋上帝、證明上帝的存在。他們聲稱，形而上學的推理可以像幾何學一樣清晰和不可辯駁。康德卻認為，人無法證明與上帝有關的事物，人無法證明與真實存在有關的事物，人無法證明事物本身的本質(zhì)?？档抡f，人只能證明與具體事物有關、與視覺世界和現(xiàn)象世界有關的事物。因此，表面看來，康德的形而上學似乎對宗教并不友好。但是，仔細觀察，我們就會發(fā)現(xiàn)并非如此。按照康德的理論，雖然宗教無法被證實，但宗教信仰還是有理由存在的。人無法證明上帝存在，人也無法證明上帝不存在。對康德來說，宗教不是一門理性的學說，而是一種信仰。至此，形而上學仍然是宗教的伙伴。

開始于巴門尼德的形而上學與宗教之間的長期聯(lián)盟終于在叔本華這里截止。叔本華贊同早期形而上學理論家關于具體事物的世界或感知世界是虛幻的這一理論。叔本華與他們的分歧在于他的關于真實存在和終極現(xiàn)實的論述。早期形而上學理論家把真實存在等同于上帝，但是，叔本華卻說，真實存在是“意志”。在無生命的物體中，這個意志表現(xiàn)為體積和引力。在有機生命中，這個意志表現(xiàn)為生的意志，即求生和繁殖的意志。叔本華所說的意志與后來的思想家所說的無意識相似。

康德為上帝的存在留有余地，叔本華卻把世界劃分為意志和思想。也就是說，他把世界劃分為意志和人對于具體事物的看法，他沒有給上帝的存在留有任何余地。從此，形而上學不再帶有神學色彩，卻帶有心理學的色彩。在西方哲學史上，叔本華是第一位堅定的無神論者。但是，叔本華的無神論不像尼采的無神論那樣喧囂、張揚，他不過是先取消上帝，后以無意識代之。早期的思想家一直認為，人基本上是有意識的和理性的。叔本華則首次宣布，人基本上是無意識的和非理性的，意識不過是無意識的表皮。

阿奎那用形而上學來證明上帝憑意志創(chuàng)造了世界。斯賓諾沙用形而上學來證明上帝不僅是隱藏于自然之中的創(chuàng)造力量，而且也就是自然本身。他認為，上帝存在于萬物之中。叔本華用形而上學來證明上帝是不存在的，并證明生命歸根到底是痛苦、毫無意義的痛苦。縱觀歷史，哲學家用形而上學證明各式各樣的假想，或證明他們想要證明的東西。當形而上學的證明得出如此之多的相互矛盾的結(jié)論時，人們怎么還能相信形而上學會導致真理呢？