但是論說文只是培根著作的一小部分。我們接觸到他的其他主要著作的時候，得到的突出的印象是他立志閎偉，掌握的知識汪洋浩瀚，思想周密而銳利。他的著作包括哲學(xué)、歷史、法律、文學(xué)各方面。他立意要重新考察和研究自然，創(chuàng)建新哲學(xué)，來代替舊的、統(tǒng)治了整個中世紀(jì)的亞里士多德的哲學(xué)。他從在劍橋大學(xué)讀書的時候起，據(jù)說就認(rèn)為亞里士多德的方法論產(chǎn)生不出有用的結(jié)果。這個萌芽思想后來就發(fā)展成《偉大的復(fù)興》（Instauratio Magna），但這個宏大的設(shè)想并沒有全部實現(xiàn)。所謂“偉大的復(fù)興”指的是科學(xué)的重振，尤其是科學(xué)方法的重建。培根1620年（在《新工具》里）宣稱，他的《偉大的復(fù)興》將包括六個部分：1.科學(xué)的分類與回顧；2.新的歸納法；3.自然史和實驗史，這些是歸納法的基礎(chǔ)；4.歸納法所得的發(fā)現(xiàn)與發(fā)明，列表舉例；5.（非新方法的）科學(xué)調(diào)查所得的發(fā)現(xiàn)與發(fā)明，暫時列表，以待用科學(xué)方法加以檢驗；6.歸納所得的結(jié)論，加以科學(xué)的綜合。這是一個宏偉的、創(chuàng)新的計劃，六個部分的中心思想就是從自然實際出發(fā)，重實驗，運用歸納法。馬克思稱他為“整個現(xiàn)代實驗科學(xué)的真正始祖”，正是指這一點。

《偉大的復(fù)興》有的部分，如第一部分，即早先用英文撰寫的著作《學(xué)術(shù)的推進(jìn)》（The Advancement of Learning，1605）的擴充，改用拉丁文撰寫，更名為《科學(xué)的尊嚴(yán)與增進(jìn)》九卷（De Dignitate et Augmentis Scientiarum Libri IX），簡稱《增進(jìn)》（De Augmentis），1623年出版。第二部分就是《新工具》（NovumOrganum），也是用拉丁文寫的，副標(biāo)題指明這是《偉大的復(fù)興》的第二部分，又名《理解大自然的正確指導(dǎo)》（Indicia vera deInterpretatione Naturae），完成略早于《增進(jìn)》，1620年出版，講的是歸納法，是他全部哲學(xué)思想和方法論的核心。但是這部作品他并沒寫完，就匆匆忙忙去寫第三部分和其他部分，以及其他著作。除了《增進(jìn)》之外，他在這期間還寫了一部《亨利七世史》（1622）［3］，發(fā)表了《論說文》最后一版（1625），并寫了《新大西島》（也未寫完）于1626年出版。因此，《偉大的復(fù)興》的第三、四、五部分都極零碎，而第六部分根本沒有遺稿。