1924年4月初，張作霖、吳佩孚為了共同的利益，重歸友好，又拉攏山西軍閥閻錫山作盟弟，從三面夾擊馮玉祥的國民軍。張作霖率軍攻克九門口、山海關(guān)、進(jìn)占灤州、唐山；張宗昌、李景林的直魯聯(lián)軍，又從側(cè)翼發(fā)起夾攻，占領(lǐng)馬廠，逼近天津；吳佩孚出兵進(jìn)攻河南，相繼占領(lǐng)了開封、鄭州，直取石家莊。北京已面臨直奉聯(lián)軍的包圍。4月中上旬，直奉聯(lián)軍派飛機(jī)對北京狂轟濫炸?！毒﹫?bào)》于13日刊載《聯(lián)軍飛機(jī)擲彈全城市民恐怖》，披露12日上午9時(shí)許，兩架飛機(jī)投36枚炸彈于西直門外車站、廣安門內(nèi)大街一帶，炸死5人，炸傷24人。轟炸還導(dǎo)致大量房屋倒塌，民眾流離失所。

這時(shí)，正在赴蘇途中的馮玉祥，不得不下令陷于奉直聯(lián)軍三面包圍的國民軍撤出北京城，開往西北地區(qū)。16日，《京報(bào)》以《國民軍昨晚實(shí)行總撤退》的消息，報(bào)道鹿鐘麟率全軍開回西北，警察權(quán)移交各調(diào)解人接收。親眼目睹了直奉軍閥無惡不作的邵飄萍，不顧個(gè)人生死，刊出署名飄萍的評論《歡送國民軍》。高度稱贊國民軍紀(jì)律嚴(yán)明，秩序井然，勇敢地表達(dá)了“本報(bào)對于國民軍第一軍始終示愛護(hù)之態(tài)度”，贊揚(yáng)國民軍是當(dāng)時(shí)中國不同于軍閥部隊(duì)的“良好之武力”，是可以承擔(dān)捍衛(wèi)國家重責(zé)的部隊(duì)，對直奉軍閥軍隊(duì)的暴行進(jìn)行了鞭笞。

國民軍撤離北京前，馮玉祥把邵飄萍的安危系在心上，先后三次派鹿鐘麟勸說邵飄萍暫時(shí)放棄《京報(bào)》，隨軍撤離北京城。這時(shí)的邵飄萍也自然明白，只要國民軍一離開北京，死神就會很快降臨到他身上，但是他顧及《京報(bào)》是黨的輿論陣地，他想利用矛盾，在險(xiǎn)境中求生存。邵飄萍支持“父讓子繼”，讓張學(xué)良接任鎮(zhèn)威軍總司令，改造東北政局。加之自認(rèn)為與張學(xué)良私交不錯(cuò)，他希望這次能冒險(xiǎn)成功，于是婉拒了鹿將軍的勸說，堅(jiān)守革命陣地。

4月18日，張作霖的前敵總指揮張宗昌率直魯聯(lián)軍率先進(jìn)城。聯(lián)軍進(jìn)城后，燒殺搶掠，無所不做，百姓敢怒不敢言，《京報(bào)》迅速刊登《聯(lián)軍之軍用券》、《京師流通軍用鈔票問題》等報(bào)道，披露士兵強(qiáng)付軍用票，只要店主稍微不愿意，就拳腳相加，商戶只好關(guān)門，京城頓時(shí)一片荒涼冷落的景象。奉軍入京后，發(fā)布27條，宣布凡“宣傳共產(chǎn)，鼓吹赤化，不分首從一律處以死刑”，并派出軍警大肆搜捕進(jìn)步學(xué)生，散發(fā)傳單，誣陷邵飄萍是“盧布黨”記者，封殺進(jìn)步報(bào)刊。張作霖公開聲稱“誰敢說我張某壞話，就休想出報(bào)！休想活命”，到處制造恐怖氣氛。這時(shí)的張作霖暗中出高額賞金捕殺邵飄萍，吳佩孚也命令捉拿邵飄萍，京報(bào)館和邵家的電話被監(jiān)聽，館舍受到監(jiān)視，邵飄萍的生命時(shí)刻處在危險(xiǎn)之中。邵飄萍的親戚、朋友、同事都勸他到外地躲避一段時(shí)間，邵飄萍沒有同意，只是將《京報(bào)》暫時(shí)交給夫人湯修慧打理，照常出報(bào)，自己避居俄國使館，且在六國飯店開了一個(gè)房間，處理公事，接待來訪。奉軍抓不到邵飄萍不甘心，以造幣廠廠長之職和二萬元大洋為誘餌，收買了曾與邵飄萍有過舊交的《大陸報(bào)》社長張翰舉。