當(dāng)松井石根了解到日軍在南京實(shí)施強(qiáng)奸、屠殺和劫掠的嚴(yán)重程度后，看得出來(lái)他極為沮喪。1937年12月18日，他對(duì)自己的一位文職助手說(shuō)：“現(xiàn)在我了解到，我們已經(jīng)不自知地給這座城市帶來(lái)最深刻的痛苦與創(chuàng)傷。每當(dāng)想到我的許多中國(guó)友人逃離南京時(shí)的悲憤和感傷之情，以及兩國(guó)關(guān)系的未來(lái)，我不禁感到灰心喪氣。我覺(jué)得自己很孤獨(dú)，而且永遠(yuǎn)都不可能對(duì)這次勝利感到歡欣鼓舞。”那天上午，松井甚至在對(duì)媒體發(fā)表的聲明中流露出一種遺憾的情緒：“我本人對(duì)民眾所遭受的苦難深感遺憾，但如果中國(guó)不改變政策，皇軍仍然必須繼續(xù)留駐。現(xiàn)在是冬天，這個(gè)季節(jié)給了中國(guó)領(lǐng)導(dǎo)人反思的時(shí)間。我本人對(duì)100萬(wàn)無(wú)辜民眾不勝同情。”

當(dāng)天晚些時(shí)候，這位日軍指揮官在為此次侵華戰(zhàn)爭(zhēng)中死去的士兵主持慰靈祭時(shí)，松井就日軍在南京實(shí)施的瘋狂暴行斥責(zé)了在場(chǎng)的300名軍官、師團(tuán)指揮官和其他相關(guān)人員。一位日本記者松本寫道：“以前從未有過(guò)一位上級(jí)軍官對(duì)下屬進(jìn)行過(guò)如此嚴(yán)厲的訓(xùn)誡。日軍對(duì)松井的行為表示難以置信，因?yàn)樵趫?chǎng)的軍官中有一位皇室的親王?！?/p>

12月19日是周日，松井搬到南京城外朝香宮的司令部，第二天便登上一艘驅(qū)逐艦返回上海。然而，或許是受絕望情緒驅(qū)使，松井一回上海就做出了更驚人的舉動(dòng)：他對(duì)《紐約時(shí)報(bào)》吐露了自己的擔(dān)憂，甚至對(duì)一位美國(guó)記者說(shuō)“日本軍隊(duì)或許是當(dāng)今世界上最無(wú)法紀(jì)的軍隊(duì)”。當(dāng)月，他還給朝香宮親王的參謀長(zhǎng)發(fā)過(guò)一條不客氣的信息，他寫道：“有傳言說(shuō)不法行為仍在持續(xù)，正因?yàn)槌銓m親王是我們的指揮官，日軍才應(yīng)該更嚴(yán)格地遵守軍紀(jì)和道義。對(duì)任何違法亂紀(jì)者都應(yīng)嚴(yán)懲不貸?！?/p>

1938年1月1日，松井仍因日本士兵在南京的惡劣行徑而郁郁寡歡。在一次祝酒時(shí)，他向一位日本外交官吐露了自己的苦悶：“我的部下犯了嚴(yán)重的錯(cuò)誤，這令人極度懊惱?！?/p>

然而強(qiáng)暴和屠殺仍在繼續(xù)，對(duì)此松井石根似乎無(wú)力阻止。如果數(shù)年之后松井在法庭上的供述可信的話，他對(duì)南京的這次短暫訪問(wèn)甚至使他在其同僚面前傷心落淚?！拔快`祭儀式結(jié)束之后，我立即召集高級(jí)軍官訓(xùn)話，甚至在他們面前流下了憤怒的淚水?！?948年被處以絞刑之前，松井對(duì)他的佛教懺悔法師說(shuō)，“當(dāng)時(shí)朝香宮親王和柳川中將都在。我斥責(zé)他們說(shuō)，由于日本士兵的暴行，我們的一切戰(zhàn)斗成果都化為泡影。可是你能想象嗎？這件事之后，那些實(shí)施暴行的士兵竟然嘲笑我?！?/p>