除油畫(huà)創(chuàng)作之外，方干民還積極參加街頭宣傳。當(dāng)年的學(xué)生王秋文后來(lái)回憶：

我們這個(gè)小組（有方干民教授參加）走到長(zhǎng)沙有名的鬧市區(qū)八角亭，發(fā)現(xiàn)有一塊一丈多寬的白粉墻，正是一塊畫(huà)壁畫(huà)的好地方。于是我們十幾個(gè)人忙碌起來(lái)，有人借來(lái)了梯子，有人用炭條打輪廓，有的勾墨線，有的涂顏色，馬上吸引了許多觀眾。但是，由于天氣太冷了，我們畫(huà)著畫(huà)著，顏料凍成了冰，畫(huà)筆也凍得像印子一樣，每個(gè)人的手也都凍得僵硬了。正在十分為難的時(shí)候，忽然有人急急忙忙端來(lái)一個(gè)火盆。這下凍硬了的顏料溶化了，畫(huà)筆也化開(kāi)了，我們凍僵了的手也烤得暖暖和和，一幅丈余長(zhǎng)的壁畫(huà)，不到一個(gè)上午就畫(huà)好了。

學(xué)校到了安江村后開(kāi)始正式復(fù)課，方干民出任教務(wù)主任，教學(xué)秩序得以很快恢復(fù)。

然而到了學(xué)期結(jié)束時(shí)，因?yàn)殡绦ｉL(zhǎng)解聘他而引發(fā)學(xué)潮。吳冠中回憶：

據(jù)說(shuō)是方干民和常書(shū)鴻互不相容，難于共事，而我們杭州跟來(lái)的學(xué)生都擁護(hù)方老師，要求滕校長(zhǎng)收回成命，于是鬧成僵局，形勢(shì)緊張。學(xué)生們攻擊常書(shū)鴻及好多位站在滕校長(zhǎng)立場(chǎng)上的教職員，記得圖書(shū)館長(zhǎng)顧良最是眾矢之的，學(xué)生追打他，他到處躲藏，學(xué)生窮追不舍，最后他逃到潘天壽住所，躲到潘老師的背后，潘老師出面勸架，顧良才免了一頓皮肉之苦。同學(xué)們封鎖安江村的所有出口，請(qǐng)求、逼迫滕固收回成命，但終于昆明開(kāi)來(lái)警衛(wèi)部隊(duì)，衛(wèi)護(hù)滕固去了昆明，同時(shí)公布方干民鼓動(dòng)風(fēng)潮并開(kāi)除兩個(gè)帶頭掀起風(fēng)潮的學(xué)生。

方干民離開(kāi)藝專后進(jìn)了國(guó)民黨黨史編纂委員會(huì)，任保管科總干事，是個(gè)閑差。他潛心作畫(huà)，在3年半時(shí)間里完成了10多幅肖像以及巨幅歷史畫(huà)《鄒容》、《肇和軍艦起義之前》、《陳英士被刺圖》等。

1944年7月，潘天壽出任國(guó)立藝專校長(zhǎng)后，方干民受聘再度回校任教?？箲?zhàn)勝利，隨學(xué)校遷至杭州。汪日章出任校長(zhǎng)后，他又被解聘。不得已在上海文廟辦了一所私人畫(huà)室，取名“中華藝術(shù)研究會(huì)”，既教畫(huà)，也做一點(diǎn)雜務(wù)。其時(shí)，圣約翰大學(xué)的中共地下黨員楊熙齡請(qǐng)他畫(huà)一幅毛澤東油畫(huà)像，準(zhǔn)備用來(lái)迎接解放，他慨然允諾。

上海解放初的方干民情緒高昂，與學(xué)生一道上街游行，創(chuàng)作了巨幅作品《淮海戰(zhàn)役》，參加在波蘭舉行的“社會(huì)主義國(guó)家綜合畫(huà)展”，獲得好評(píng)。這使他在1951年3月調(diào)入南京軍事學(xué)院專門(mén)從事軍史畫(huà)創(chuàng)作。由于單位的特殊性，安然度過(guò)“反右”運(yùn)動(dòng)。

1958年，方干民又回到浙江美院任教。具體原因不得而知，那時(shí)個(gè)人對(duì)職業(yè)已很少有選擇權(quán)，調(diào)動(dòng)多是組織決定的。這里不能不說(shuō)到他的大姨子、后來(lái)蜚聲海外文壇的蘇雪林——鋒芒畢露的她到了臺(tái)灣后堅(jiān)持反共立場(chǎng)，聲稱自己是20世紀(jì)30年代僅有的與“共黨嘍啰”猛烈筆戰(zhàn)的作家。不知道是不是因此影響到方的命運(yùn)？

回美院后，日子就不那么好過(guò)了。當(dāng)時(shí)把他作為教師中的反面典型，“這樣畫(huà)也批判，那樣畫(huà)也批判”。盡管十分小心，到了“文化大革命”，方干民還是遭到殘酷斗爭(zhēng)，罪名是反動(dòng)學(xué)術(shù)權(quán)威和國(guó)民黨特務(wù)，關(guān)入牛棚后，萬(wàn)念俱灰的他服毒自殺，幸而未遂。

死過(guò)一次的方干民變得沉默寡言，他以畫(huà)筆來(lái)消磨時(shí)間，到各地寫(xiě)生，但作品已沒(méi)有了早年那種氣勢(shì)，藝術(shù)表現(xiàn)上倒間或重新顯出立方主義的若干痕跡。