朱祁鈺認為于謙等人說得不錯，但他擔心京師兵力不足，人心惶恐，抵擋不了蒙古人的鐵騎。于謙建議急調兩京、河南備操軍，山東及南京沿海備倭軍，江北及北京諸府運糧軍亟赴京師。

三天過去了，遣往也先大營的使節(jié)還沒有回來，情勢緊急，太后召百官集于闕下，宣布由郕王監(jiān)國，總領百官，朝中大小事務皆須聽郕王號令。立朱祈鎮(zhèn)的兒子，年方二歲的朱見深為皇太子，命郕王輔之，同時詔告天下。

這一日，郕王攝朝議事，地點放在午門左門。還沒開始議事，就有右都御史陳鎰伏地慟哭，請求對釀成這起激變的罪魁禍首王振進行清算，言官們更是言辭激烈。王振的黨徒馬順站出來大聲喝斥言官們胡說八道，給事中王竑當廷飽以老拳，一把扯過他的頭發(fā)扭作一團，一邊咬一邊罵：你倚仗著王振這個奸人作威作福，都這時候了還敢這樣說話？文官們也隨之群毆，三下兩下就把他給打死了。一時朝堂大亂，值勤的衛(wèi)卒有許多是王振的私人，聲勢洶洶，只等號令就要出手。朱祁鈺嚇得直想離席而去。于謙走上前去一把拉住他，讓他趕緊宣諭馬順等人罪當該死，朝堂之上不必再作爭論，趕緊把事情給平息下去。

等到朝堂重新恢復了秩序，于謙這才發(fā)現(xiàn)，剛才情急之下用力過大，連朝服的袍袖都給扯裂了。退出左掖門時，吏部尚書王直拉著于謙的手說：以后國家就全靠你了，今天的事這般危急，要不是你，就是有一百個王直也解決不了。

王振全族無論少長全都被斬，抄家抄出金銀六十余庫，玉盤百余只，高達六七尺的珊瑚二十株，其他珍玩不計其數(shù)，悉數(shù)沒入國庫。王振的親信郭敬正好從大同逃歸京師，也被抄家下獄。都督同知石亨接戰(zhàn)甫始單騎逃回，本以失律削職，因朝廷正在用人之際，在于謙建議下得以寬大處理，令他總兵十營擔任京城的守衛(wèi)工作。

當是時，上下皆倚重剛遷為兵部尚書的于謙，于謙亦毅然以社稷安危為己任。他向朱祁鈺建議說，瓦剌剛得志，必定輕視我朝，長驅南犯，要嚴令諸邊守將嚴加防范，京城兵營空虛，兵械也告盡，應分道招募兵員，令工部修繕戰(zhàn)具器甲，把外城的居民都遷入內城，分兵九門，列營于城門之外嚴陣以待，文臣知兵的，宜用為巡撫，武臣有勇有謀的，宜用為將帥。

靠近京師的通州是帝國糧食儲運的一個重要中轉站，有人提議，瓦剌大軍壓境，糧食搬運不及，應該把通州倉燒了，以免被瓦剌搶去。應天巡撫周忱認為，通州倉米共有數(shù)百萬石，可充京軍一年的軍餉，付之一炬實在太可惜，官府搬運不及，可發(fā)動京中軍民自發(fā)前往運糧，把糧米從通州運到京城的，官府按其運糧數(shù)量發(fā)給薪金。于謙聽取了他的建議，把通州的糧全都運到了京城。