李鴻章提出的停戰(zhàn)要求被拒絕后，日本國內(nèi)一片歡騰，主戰(zhàn)輿論更是高漲。日本各報即登載了詩人山田松堂的一首絕詩：三軍萬里向天津，正是東風桃李辰。星使乞和和未就，燕京將屬手中春。因受日本朝野主戰(zhàn)氣焰影響，郡馬縣有個名叫小山豐太郎的無業(yè)之徒，以為欽差頭等全權大臣李鴻章是暗中與日本挑釁的主持，遂決意行刺。中日第三次談判的那天，他持短槍躲在外濱町郵局前街道拐角處，待李鴻章會談結束后乘轎返回住地引接寺，在擁擠的人群中穿行途經(jīng)此處時，便直奔轎前，手按轎夫肩膀，趁其驚訝停進之際，對準李鴻章就是一槍，槍彈擊中李左眼下。李鴻章畢竟是久經(jīng)沙場的老將，中槍后，即以手掩創(chuàng)口止血，忍劇痛堅持至引接寺旅館門口下轎，若無其事地徒步登階入內(nèi)。

李鴻章遇刺后，日本政府既狼狽又緊張。伊藤和陸奧尤怕李鴻章借此回國中斷談判，亦怕西方列強乘機干涉。他們一面急促日本山口地方法院審判刺客，一面到引接寺探視李鴻章的傷勢藉以慰問。睦仁天皇接報后也憂愁惋惜，特降詔嚴辦兇犯，以保國家榮耀聲名；還派侍從武官為特使偕兩軍醫(yī)總監(jiān)同赴馬關“慰問李病”?；屎笠噘n予御制繃帶，并派護士十二名前去侍養(yǎng)。

李鴻章遇刺的當夜，陸奧宗光即從住地大吉樓至伊藤的下榻處梅坊密商對策，擬即時允許李鴻章曾一再懇請的休戰(zhàn)。但當他們將停戰(zhàn)意向電告在廣島的內(nèi)閣閣員及大本營重臣時，除新任陸軍大臣山縣有朋一人外幾乎全都反對。于是伊藤博文親抵廣島說服文武重臣，并上疏天皇使停戰(zhàn)之策得到裁可。接著，他立即電告陸奧宗光，陸氏接電便至引接寺，就李鴻章病榻陳述日皇允諾停戰(zhàn)之意。病榻上的李鴻章得知日方同意停戰(zhàn)后，心情稍寬，即命兒子李經(jīng)方與日方簽訂了《中日停戰(zhàn)協(xié)定》?？墒窃趨f(xié)定中，日方堅持將臺灣、澎湖排除在停戰(zhàn)之外，以為割占臺灣預作準備。

停戰(zhàn)協(xié)定簽字后，李鴻章臥在榻上提出續(xù)開和議談判，陸奧表示同意。次日，他邀李經(jīng)方進行第四次談判，商談擬定和約的程序方法。陸奧知道中方急于明了全部和款，就故意提出逐條進行商議。李經(jīng)方則力主在全部條款閱畢后再逐條議商，說締結和約，茲事體大；不閱讀全部條款，不能逐條表明意見。陸奧聽罷，說同意李經(jīng)方所擬的程序也無妨，不過他提出：日方出示和約底稿后中方須在三至四天內(nèi)答復。李經(jīng)方即應允可行。

當天下午，陸奧宗光即命人將和約底稿送致李鴻章，其內(nèi)容是：（一）清國認明朝鮮國確為完全無缺之獨立自主；（二）清國將京盛省南部地方、臺灣全島及澎湖列島永遠讓與日本國；（三）清國賠償日本軍費庫平銀三萬萬兩；（四）清國已開通商口岸之外，更開順天府、沙市、湘潭、重慶、梧州、蘇州、杭州七處為通商口岸，日本國臣民運進清國各口貨物減稅，免除厘金，并得在清國制造一切貨物。李鴻章見了這個約稿，差點暈了過去。他早知道日本所欲甚奢，卻未料到如此窮奢極欲。割取清國大量疆土，勒索巨額賠款，其所謀獲的不義利益遠遠超過了西方列強所得的總和！他急與科士達相商，科士達建議電請總署密告英、俄、法三公使，以爭取他們從中干涉。李鴻章即示照辦。

清廷總理衙門收到李鴻章發(fā)出的日方約稿條款電文后，大臣們個個相驚失色。約稿條款轉(zhuǎn)送軍機處后，翁同龢見了，先是頭暈目眩，轉(zhuǎn)而聲淚俱下。他與眾軍機大臣馬上將約稿內(nèi)容上奏光緒帝。

光緒帝得奏大驚，即召見全體樞臣議商。然而議商時各大臣所見不一：孫毓汶言戰(zhàn)字不能再提，必須議和；而翁同龢泣訴臺灣不可棄；禮親王世鐸、慶親王奕匡則認為遼東緊靠陪都奉天，又逼近京師，保住遼東要比保住臺灣重要。議商無所決，清廷一直未給李鴻章復電。