一開始，崇禎重新起用袁崇煥，兩人處于蜜月期。袁崇煥在崇禎元年（公元1628年）七月接受皇帝召對(duì)時(shí)，夸下"五年平遼"的海口。這不但讓皇帝欣喜，更讓在旁的大臣們驚訝。因?yàn)?，在?dāng)時(shí)明朝與后金的對(duì)抗中，明軍能在遼東抑住后金軍隊(duì)的進(jìn)攻，已屬不易。"五年而遼東外患可平，全遼可復(fù)"的豪言壯語(yǔ)，無(wú)異夢(mèng)囈。袁崇煥這么說(shuō)，據(jù)他自己講，不過(guò)是為了"聊慰上意"，暫時(shí)寬慰寬慰思宗而已。然而，思宗是一個(gè)急于求功、遇事苛刻的主子，到時(shí)可是要循名責(zé)實(shí)的。袁崇煥向崇禎提出三項(xiàng)基本策略，循序漸進(jìn)，以克竟全功。他上疏還表示，希望皇帝全力信任、支援，不要聽信朝臣的妒忌之言。皇帝自然滿口答應(yīng)，還給他蟒袍、玉帶與銀幣，前二者袁崇煥以尚未建功，辭而不受。但很快，袁崇煥在崇禎心中的地位就由紅轉(zhuǎn)黑了。

袁崇煥擅殺毛文龍開始令崇禎生疑。毛文龍何許人也？他是明朝正式任命的東江總兵。東江就是鴨綠江近?？诘钠u，和鴨綠江的獐子島、鹿島構(gòu)成鼎足之勢(shì)，位于遼東、朝鮮、山東登萊二州的中間，號(hào)稱孔道。天啟三年，毛文龍率部攻陷了遼東要地金州，不但打通了水路到登州的糧道，還可和皮島互為犄角之勢(shì)，從陸路牽制后金的部隊(duì)。他也由此功，升任左都督，掛將軍印，并擁有了一把尚方寶劍，進(jìn)一步擴(kuò)大了他在東江的權(quán)力，成為當(dāng)時(shí)遼東牽制后金的一支重要力量。

毛文龍作為封疆大吏，手握重兵，又孤懸海外，飛揚(yáng)跋扈是難免的，但無(wú)論熹宗還是思宗，都對(duì)毛文龍十分倚重，并沒(méi)有過(guò)多的責(zé)難。這種狀況，一直持續(xù)到袁崇煥的再度啟用。對(duì)毛總兵的種種劣跡袁崇煥早有耳聞，這個(gè)毛文龍攀附朝中權(quán)貴、營(yíng)私結(jié)黨，屢屢不聽調(diào)遣。不僅如此，毛文龍治軍不嚴(yán)，公然在軍營(yíng)中蓄養(yǎng)倡優(yōu)，整個(gè)部隊(duì)軍紀(jì)渙散，戰(zhàn)斗力極弱。更讓袁崇煥不能容忍的是，一向虛報(bào)部隊(duì)員額，冒領(lǐng)巨額軍餉的毛文龍居然多次以軍餉不足來(lái)要挾，袁督師殺毛之心漸起。

崇禎二年五月二十九日，在支付了毛文龍十萬(wàn)餉銀，平息了毛文龍的不滿后不久，袁崇煥親赴雙島，在那里會(huì)見(jiàn)了從皮島趕來(lái)的毛文龍，并于六月三日，檢閱了島上的軍隊(duì)。此時(shí)，袁崇煥的殺毛之心未決，他希望毛文龍能夠急流勇退。六月四日在毛文龍為袁舉辦的接風(fēng)晚宴上，兩人的一番談話頗有些耐人尋味。

袁：久勞邊塞，杭州西湖盡有樂(lè)地。（告老還鄉(xiāng)吧。）

毛：久有此心，但唯我知滅奴孔核，滅了東夷，朝鮮文弱，可襲而有之。（我還年輕。）

袁：朝鮮不勤遠(yuǎn)略，當(dāng)有代勞者。（我有代替的人選。）

毛：此處誰(shuí)代得？（還有誰(shuí)比我更合適？）

然而，一切都在此后的一天發(fā)生了根本的逆轉(zhuǎn)。六月五日，在袁崇煥的營(yíng)帳中，當(dāng)著毛文龍的諸多親信，袁崇煥以殺降人，難民冒功；侵盜軍糧，擅開馬市；剽掠商船，強(qiáng)娶民女等十二大罪名，用尚方寶劍取了毛文龍的首級(jí)，并且收回了毛文龍的將軍印和尚方寶劍，同時(shí)也吞并了毛文龍的部隊(duì)。

不能說(shuō)，袁崇煥殺毛文龍沒(méi)有道理，毛的桀驁不馴、擁兵自重、不服節(jié)制，都有礙于袁崇煥的平遼方略。但是否夠得上一個(gè)死罪，還有商榷的余地。畢竟，毛文龍守島有功；畢竟，毛文龍雖然平遼不足，牽敵有余；畢竟，毛文龍還是一位知曉軍事的干練統(tǒng)帥。

一位督師用尚方劍殺死了一位同樣擁有尚方劍的總兵官，應(yīng)該算是那個(gè)時(shí)代的一條爆炸性的新聞。崇禎聞之，"意殊駭念"，也嚇了一跳，但事已至此，還能有什么辦法呢，他決定堅(jiān)定地站在袁崇煥的一邊。這完全是因?yàn)樵鐭〞r(shí)握重兵，不得已而接受了這個(gè)事實(shí)，并不是真的從心里諒解了袁崇煥的做法。后來(lái)審訊袁崇煥時(shí)的罪狀之一就是"專戮大帥"，可為明證。

既然，皇帝已經(jīng)表態(tài)了，朝臣們也不敢有什么不同的意見(jiàn)，于是大家都向積極的一面思考。不去想，也不敢去想這是否應(yīng)該算是一件皇太極想做而不能做到的事。