為使清廷鼓勵(lì)正途出身人員報(bào)考，奕等人再遞上折、片各一件，進(jìn)一步闡明學(xué)習(xí)西方的必要性，強(qiáng)調(diào)如仍茍且偷安、不思振作，后患將不堪設(shè)想。他們斥責(zé)倭仁以“道學(xué)鳴高”，故意危言聳聽(tīng)，總以“師事夷人”、“奉夷為師”指責(zé)別人，其目的無(wú)非是阻止人們報(bào)考同文館。他們聲稱(chēng)，同文館雇覓洋人不過(guò)是講授天文算學(xué)，早已奏明入館學(xué)習(xí)者不修弟子之禮，該折業(yè)經(jīng)發(fā)抄，倭仁豈有不知？為什么信口開(kāi)河，肆意攻擊？他們繼續(xù)將倭仁的軍：倭仁不是認(rèn)為中國(guó)早有精通天文算學(xué)、船堅(jiān)炮利的人才，只是沒(méi)有精心訪求嗎？他們于是提出希望朝廷下旨飭令倭仁保薦數(shù)人，即行擇地另設(shè)一館，由他督飭。清廷還真接受了奕等人的請(qǐng)求，發(fā)布“上諭”，要倭仁保薦幾名精通天文算學(xué)人才另行擇地設(shè)館，由倭仁負(fù)責(zé)。在這種情況下，倭仁不得不承認(rèn)“意中并無(wú)精于天文算學(xué)之人，不敢妄保”，請(qǐng)求不必另行設(shè)館。但是，他仍堅(jiān)持自己原來(lái)的觀點(diǎn)，認(rèn)為天文算學(xué)只為最不重要，“并非欲自強(qiáng)必須講明算法也”。

在奕等人的策劃下，清廷任命倭仁在總理衙門(mén)行走，想逼使他也不能不涉及洋務(wù)。但倭仁表示堅(jiān)辭，未獲批準(zhǔn)，便稱(chēng)病乞假。

當(dāng)倭仁在洋務(wù)派的步步進(jìn)逼下處境十分尷尬的時(shí)候，候補(bǔ)直隸州知州楊廷熙通過(guò)都察院遞上《請(qǐng)撤銷(xiāo)同文館以弭天變折》，以“天象示警”來(lái)為頑固派辯護(hù)。他指說(shuō)今年春季以來(lái)久旱不雨，疫癘流行，是“天象示警”，“京師中街談巷議，皆以為同文館之設(shè)，強(qiáng)詞奪理、師敵忘仇、御夷失策所致”，認(rèn)為總理衙門(mén)請(qǐng)求設(shè)立同文館是“不當(dāng)于天理，不洽于人心，不合于眾論”，“潰夷夏之防，為亂階之倡”。為了“杜亂萌而端風(fēng)教，弭天變而順人心”，必須“收回成命”，將同文館予以裁撤，或者禁止科甲正途人員報(bào)考天文算學(xué)館。他認(rèn)為中國(guó)欲求自強(qiáng)，只需要“紀(jì)綱立，號(hào)令行，政教興”，“作忠義之氣于行間，盡教養(yǎng)之懷于民上”，則洋人雖眾，槍炮雖利，輪船雖多，亦斷不敢肆虐于中國(guó)。他強(qiáng)調(diào)西方國(guó)家乃中國(guó)之“敵國(guó)”與“世仇”，學(xué)習(xí)西方的自然科學(xué)知識(shí)就是“師事仇敵”，“無(wú)論偏長(zhǎng)薄技不足為中國(guó)師，即多才多藝層出不窮，而華夷之辨不得不嚴(yán)，尊卑之分不得不定，名器之重不得不惜”。而科甲正途人員一旦使之師事仇敵，則“忠義之氣自此消矣，廉恥之道自此喪矣，機(jī)械變?cè)p之行自此起矣。圣賢之大道不修，士林之節(jié)概不講”，后果非?？膳隆Ｋ盐鲗W(xué)視為洪水猛獸，寧可使中國(guó)落后挨打，也決不可向敵人學(xué)習(xí)。楊廷熙自恃有倭仁為后臺(tái)，又掌握儒學(xué)正統(tǒng)“話語(yǔ)權(quán)”，所以在奏折中還肆無(wú)忌憚地攻擊總理衙門(mén)諸大臣，甚至直接涉及清廷最高統(tǒng)治者：“西教本不行于中國(guó)，而總理衙門(mén)請(qǐng)皇上導(dǎo)之使行”，該衙門(mén)大臣“專(zhuān)擅挾持，啟皇上以拒諫飾非之漸”。

頑固派不僅從抽象的理學(xué)角度反駁洋務(wù)派，而且把主張學(xué)習(xí)西方者扣上了“師事夷人”、“奉夷為師”、“師事仇敵”等類(lèi)似于“里通外國(guó)”、“漢奸”等政治性大帽子，在近代中國(guó)屢被侵略的背景下，這種言辭更易激起人們的義憤。

最后，奕等人只能以自請(qǐng)“開(kāi)去總理衙門(mén)差使”相挾?？吹絻膳蓜?shì)同水火，爭(zhēng)論愈演愈烈，繼續(xù)下去將使朝政癱瘓，清廷便于1867年6月30日發(fā)布“上諭”，一方面嚴(yán)批楊廷熙、倭仁等人，一方面又以“與國(guó)家休戚相關(guān)”為由，要倭仁“不應(yīng)堅(jiān)持己見(jiàn)”，與總理衙門(mén)王大臣等“和衷商酌，共濟(jì)時(shí)艱”，同時(shí)飭令奕等應(yīng)“不避嫌怨，力任其難，豈可顧恤浮言，稍涉推諉”。這場(chǎng)爭(zhēng)論遂告結(jié)束。

這次歷時(shí)半年激烈爭(zhēng)論的結(jié)果，雙方各有得失。頑固派反對(duì)設(shè)立天文算學(xué)館的企圖畢竟沒(méi)有得逞，就此而言，洋務(wù)派勝。但在頑固派的影響下，報(bào)考同文館的人數(shù)銳減，特別是正途出身人員依然寥寥無(wú)幾。頑固派的主張?jiān)谏鐣?huì)上得到了更廣泛的支持，形成一股相當(dāng)強(qiáng)大的輿論力量，“京師各省士大夫聚黨私議，約法阻攔，甚且以無(wú)稽謠言煽惑人心”。名士李慈銘在日記中就寫(xiě)道，“正途”人員學(xué)西學(xué)是“以中華之儒臣而為丑夷之學(xué)子，稍有人心，宜不肯就，而又群焉趨之。蓋學(xué)術(shù)不明，禮義盡喪，士習(xí)卑污，遂至于此。馴將夷夏不別，人道淪胥，家國(guó)之憂，非可言究”。一時(shí)還出現(xiàn)不少對(duì)聯(lián)：“詭計(jì)本多端，使小朝廷設(shè)同文之館；軍機(jī)無(wú)遠(yuǎn)略，誘佳子弟拜異類(lèi)為師?！薄拔赐裕刮膶??！薄翱组T(mén)弟子，鬼谷先生。”還有作俚語(yǔ)笑罵的，如“胡鬧，胡鬧！教人都從了天主教！”人言籍籍，群起非難，報(bào)考天文算學(xué)館的人數(shù)更少?？偫硌瞄T(mén)1867年7月初奏稱(chēng)，“兩月以來(lái)，投考之人，正途與監(jiān)生雜項(xiàng)人員相間……共計(jì)投考正雜各項(xiàng)人員九十八名”，臨時(shí)又有二十六名沒(méi)有參加考試。參加考試的七十二名中，不少是因?yàn)榇鰳O為優(yōu)厚才來(lái)報(bào)考，所以學(xué)生質(zhì)量很差。最后只得勉強(qiáng)錄取了三十名，第二年就淘汰了二十名，最后畢業(yè)的只有五名，天文算學(xué)館名存實(shí)亡，洋務(wù)派倡學(xué)自然科學(xué)知識(shí)的計(jì)劃實(shí)際嚴(yán)重受挫。所以就此而言，頑固派勝。

這次爭(zhēng)論的實(shí)質(zhì)，是西學(xué)的價(jià)值問(wèn)題，亦即自然科學(xué)知識(shí)是否具有“普適性”。任何一種知識(shí)都產(chǎn)生于具體的“地方”，所以每種知識(shí)的源起都具有“地方性”，如果因此認(rèn)為任何知識(shí)都沒(méi)有普適性，那么所謂交流、交往將沒(méi)有意義，不同文明之間根本無(wú)法溝通，人類(lèi)也不可能發(fā)展進(jìn)步。發(fā)端于西方的近代自然科學(xué)知識(shí)在引入中國(guó)之初被稱(chēng)為“西學(xué)”，表明時(shí)人認(rèn)為這只是一種地方性知識(shí)。頑固派堅(jiān)決反對(duì)引入，即認(rèn)為這種知識(shí)不具普適性、不應(yīng)為“我”所有，而且是對(duì)“我”構(gòu)成威脅的“他者”。洋務(wù)派雖不可能清晰認(rèn)識(shí)到，自然也未明言這是一種具有普適性的知識(shí)，但強(qiáng)調(diào)能為我用，畢竟是對(duì)其普適性的初步承認(rèn)。聲光電化、天文歷算這類(lèi)知識(shí)從“西學(xué)”到“科學(xué)”的名稱(chēng)之變，實(shí)即“身份之變”，表明近代中國(guó)最終承認(rèn)這是一種普適性知識(shí)體系?，F(xiàn)在，科學(xué)更是被提高到“科教興國(guó)”的高度。中外歷史表明，國(guó)之興衰、社會(huì)發(fā)展之快慢，與對(duì)這種普適性知識(shí)接受的難易確實(shí)大有關(guān)系。