李巖、顧君恩的意見，是很正確的。但并未為自成所采納，而遭到了牛金星等的忌恨，當退出北京后，李巖與其弟李牟被牛金星所殺，自成遂失去與河南地方的聯(lián)系。

第二是由于農(nóng)民階級的保守性，隨勝利以俱來的"改朝換代"思想也滋長起來。在這四十天內(nèi)，天天是修定朝儀，改革官制，忙于封侯拜相，忙于登上皇帝的寶座，對于清兵的入侵，卻麻痹大意，只派明朝的降將唐通等去把守京東灤河一帶，因之清兵得以長驅(qū)直入。

第三是明末農(nóng)民起義是沒有先進階級領(lǐng)導的，這就不免失敗。加之起義軍部分領(lǐng)袖進城后，日趨腐化，安逸享樂的現(xiàn)象未能及時糾正，這就加速了大順政權(quán)的失敗。此外，農(nóng)民軍對待明朝降官的政策也是缺少策略的，雖然農(nóng)民群眾受到明朝統(tǒng)治階級多年的壓迫，應(yīng)當作適當?shù)奶幚恚抛阋云揭秩嗣駪嵓さ那榫w，這是對的。但是把懲辦貪官污吏的工作拖到大順政權(quán)鞏固的時候再做，似乎更妥當一些。對于明朝的官吏，只錄用四品以下的小官，三品以上的一概不用，其貪贓昭著的，發(fā)刑官責罰，也是對的。但劉宗敏等，把三品以上的降官，如陳演、魏藻德等八百余人，全加拷掠追逼，到后來更是凡官必贓，有錢必追，甚至商人和市民，也都不免。這種做法打擊面太廣了，農(nóng)民政權(quán)逐漸失去了商人和市民的同情支持。由于部分農(nóng)民軍領(lǐng)袖享樂腐化，再加上給養(yǎng)困難以致農(nóng)民軍紀律松弛、人心動搖?！读骺苁冀K錄》的著者戴笠說："闖賊見人心動搖，大行賞賚；小將百兩、兵十兩、取市肆布給兵。初賊略不犯民，散居民家，唯收兵器火藥，取飲食，漸至淫掠、箠、斫，人情大擾。牛金星、顧君恩以囑劉宗敏，宗敏曰：'此時只憂兵變，民何足言，軍興日廢萬金，安所取給?'"戴笠：《懷陵流寇始終錄》。這段話充分說明了當日農(nóng)民軍內(nèi)部的混亂情況。

農(nóng)民軍內(nèi)部分裂，紀律松弛，軍事疏忽，部分農(nóng)民軍領(lǐng)袖享樂腐化，已經(jīng)種下了失敗的根源，再加上以吳三桂為首的漢奸集團，不惜出賣祖國，勾結(jié)新興的清軍，合力攻擊大順政權(quán)，迫使農(nóng)民軍不得不退出北京，從此農(nóng)民起義就轉(zhuǎn)入了抗清的階段了。