兩個(gè)多月后，即1907年12月，孫中山發(fā)動(dòng)了對(duì)清廷的第六次打擊，這就是有名的鎮(zhèn)南關(guān)起義，也稱丁未鎮(zhèn)南關(guān)之役。

其實(shí)在防城起義以前，孫中山已在注意鎮(zhèn)南關(guān)的軍事。從戰(zhàn)略上，他是這樣考慮的：以鎮(zhèn)南關(guān)為主要牽制，同時(shí)攻取水口關(guān)，兩日內(nèi)襲取憑祥、龍?zhí)?；再兩日克?fù)龍州，進(jìn)取南寧。南邊襲擊河口，擁有風(fēng)魔嶺天險(xiǎn)，這就可以直接控制蒙自。通過(guò)這里，又可走建水一線，襲擾昆明；同時(shí)潮州陳涌波、許雪秋正待再起，黃興家鄉(xiāng)，正有馬福益會(huì)黨也在臥薪嘗膽……四面蜂起，就是清朝廷的四面楚歌。

黃明堂首先發(fā)動(dòng)。此前兩月，孫中山已派黃明堂為鎮(zhèn)南關(guān)都督，預(yù)為準(zhǔn)備。

11月21日，在越南河內(nèi)，孫中山招集黃興、胡漢民及三合會(huì)首領(lǐng)多人，密商起義事宜。12月初，黃明堂奉孫中山之命，率廣西健兒攻打鎮(zhèn)南關(guān)，攜帶快槍四十支，由山背間縋繩直取右輔山第三炮臺(tái)，守軍猝不及防，紛紛投降，革命軍乘勝占領(lǐng)第二、第一炮臺(tái)。清軍大舉反撲，義軍暫時(shí)撤至河內(nèi)等處，但翌日義軍即開(kāi)始反擊。孫中山、黃興、胡漢民、胡毅生以及日本義士池亨吉、法國(guó)退職軍人狄氏等人，乘火車北進(jìn)，傍晚抵達(dá)鎮(zhèn)南關(guān)，以火炬照明登山。目的地是鎮(zhèn)南關(guān)的山背，至少爬山四個(gè)小時(shí)。黃興因?yàn)榕?，胡漢民因?yàn)槭?，法?guó)軍官因?yàn)楸秤泄ぞ呦洌麄內(nèi)私詺獯跤?。起義軍所據(jù)者，是山上三個(gè)炮臺(tái)。4日上午，清軍援兵龍濟(jì)光、陸榮廷部隊(duì)開(kāi)始攻擊。孫中山、黃興命令發(fā)炮，狄氏親自操炮，向遠(yuǎn)距離清軍隊(duì)形轟擊。狄氏平時(shí)雖抽鴉片煙，技術(shù)卻不含糊，一炮過(guò)去，正中敵心，頓時(shí)死傷六十多人，其前進(jìn)隊(duì)形立馬混亂。于是大、小炮更密集轟擊，只見(jiàn)敵營(yíng)處處冒煙。

敵人靠近時(shí)候，孫中山、黃興親自操槍射擊，打中不少敵人。起義軍有人負(fù)了傷，孫中山親自去搶救包扎。他早年就翻譯過(guò)紅十字方面的專業(yè)救護(hù)著作，又是醫(yī)生出身。孫中山感慨地說(shuō)：“反對(duì)清政府二十余年，此日始得親發(fā)炮擊清軍耳！”

晚上，黃明堂率部留守，孫中山、黃興從小路下山，因天下大雨，無(wú)法火炬照明，夜半方抵達(dá)山下同志家。陸榮廷即率四千清兵反攻，黃明堂率部堅(jiān)守七晝夜，以援軍未至，眾寡懸殊，乃突圍下山。鎮(zhèn)南關(guān)之役打到這個(gè)地步還算不錯(cuò)，但就整個(gè)戰(zhàn)略而言，未達(dá)目的。原先的意圖是襲取鎮(zhèn)南關(guān)后，即占領(lǐng)三要塞，集合十萬(wàn)大山一帶的會(huì)黨，會(huì)攻龍州。因?yàn)閼?zhàn)事失利，只好放棄了。