從此之后，蘇區(qū)中央局自覺或不自覺執(zhí)行王明路線的多數(shù)領(lǐng)導(dǎo)同志，與毛澤東同志的思想相左，并發(fā)生對抗。為此，蘇區(qū)中央局于十月上旬召開了史家所稱的“寧都會議”。用與會人的話說：“開展了中央局從未有過的反傾向的斗爭”。自然，這斗爭的矛頭是對準(zhǔn)毛澤東同志的。并提出要把毛澤東召回后方，專負(fù)中央政府工作的責(zé)任，而由周恩來負(fù)戰(zhàn)爭領(lǐng)導(dǎo)的總責(zé)。

對此，周恩來十分清楚：這等于解除毛澤東的軍事指揮權(quán)。他在戰(zhàn)爭的實踐中，逐步認(rèn)識到毛澤東的軍事指揮才干，加之紅軍的基本隊伍，是由毛澤東和朱德同志從井岡山一步一步帶出來的，故不贊成這種意見。他強(qiáng)調(diào)指出：“澤東積年的經(jīng)驗多偏于作戰(zhàn)，他的興趣亦在主持戰(zhàn)爭”，“如在前方則可吸引他供獻(xiàn)不少意見，對戰(zhàn)爭有幫助”。因此，他堅持：“一種是由我負(fù)主持戰(zhàn)爭的全責(zé)，澤東仍留前方助理；另一種是澤東負(fù)指揮戰(zhàn)爭全責(zé)，我負(fù)監(jiān)督行動方針的執(zhí)行?！笔潞笞氛摚涸诋?dāng)時的情況下，周恩來的這兩點建議是可行的，對革命也是有利的。

但是，蘇區(qū)中央局多數(shù)領(lǐng)導(dǎo)同志堅持要剝奪毛澤東同志的軍事指揮權(quán)，加之毛澤東絕不屈服的性格使然，周恩來的建議落空了。最后，毛澤東被批準(zhǔn)暫時請病假回后方。結(jié)果，那些堅持剝奪毛澤東指揮權(quán)的同志必然對周恩來不滿，他們致電在上海的臨時中央，批評周在會上“不給澤東錯誤以明確的批評，反而有些地方替他解釋掩護(hù)”，認(rèn)為周“在斗爭上是調(diào)和的，是模糊了已經(jīng)展開了的斗爭戰(zhàn)線”。

批評毛澤東的同志是錯誤的，責(zé)備周恩來的同志仍然敬服周的為人和才干。雖經(jīng)多次所謂磋商，到十月二十八日，上海臨時中央下達(dá)命令：以周恩來兼任紅一方面軍總政委。

這樣一來，毛澤東的指揮權(quán)就被剝奪了。雖說在周恩來和朱德等同志的領(lǐng)導(dǎo)下，勝利地粉碎了敵人的第四次“圍剿”，但隨著上海臨時中央局遷入中央蘇區(qū)，周恩來的指揮權(quán)也漸漸地被博古、李德等人剝奪了，使得中央蘇區(qū)第五次反“圍剿”陷入了絕境，不得不作出戰(zhàn)略轉(zhuǎn)移的決定。

說到紅軍舉行戰(zhàn)略轉(zhuǎn)移——長征，就在周恩來的心中激起很大的波瀾，使他不能不想起近一年來發(fā)生的令人痛心的戰(zhàn)略失誤……

第四次反“圍剿”正在勝利進(jìn)行的時候，原在上海的臨時中央政治局處境日益惡化，并于一九三三年一月十七日作出決定遷往中央蘇區(qū)。臨時中央負(fù)責(zé)人博古等一到中央蘇區(qū)，立刻把中央蘇區(qū)的黨、政、軍大權(quán)抓到自己的手里，為推行其“左”傾路線，借批判所謂的“羅明路線”，無情地打擊了一大批堅持執(zhí)行毛澤東同志正確路線的干部。自然，毛澤東同志的處境也就可想而知了。對此，周恩來同志是很痛苦的。接著，遷到中央蘇區(qū)的臨時中央與蘇區(qū)中央局合并，以博古負(fù)總責(zé)，周恩來的蘇區(qū)中央局書記的名義也就不存在了。年僅二十六歲、且從未打過仗的博古同志等下車伊始，就批評負(fù)責(zé)軍事指揮的周恩來和朱德同志，強(qiáng)行“要求將一方面軍主力分成兩個部分作戰(zhàn)”，這就是所謂的“兩個拳頭打人”。從此，周恩來的許多有益的建議被否決。

是年九月，蔣介石發(fā)動所謂“三分軍事、七分政治”的第五次“圍剿”。恰在這時，共產(chǎn)國際派來的李德被博古聘為軍事顧問由上海來到中央蘇區(qū)。不懂軍事的博古遂把紅軍的指揮大權(quán)交給了這位不會說中國話，更不懂中國國情的李德。從此，“李德的獨斷專行取代了軍委的集體領(lǐng)導(dǎo)”，“由李德一人躲在房子里憑著地圖指揮作戰(zhàn)”。加之“當(dāng)時中央的錯誤領(lǐng)導(dǎo)，和李德本人的專橫作風(fēng)，使他成了一個地道的‘太上皇’”。結(jié)果，使第五次反“圍剿”從一開始，就陷于不利的作戰(zhàn)態(tài)勢。接著，博古等人又錯誤地處理“福建事變”，使得粉碎第五次“圍剿”失掉了最好的機(jī)會。同時，使得紅軍陷入更大的被動中！翌年一月中旬，中共中央在瑞金召開六屆五中全會，博古等人不顧周恩來的反對，在指責(zé)毛澤東為“富農(nóng)路線”的同時，堅持以張聞天代替毛澤東擔(dān)任人民委員會主席。為了搬掉最后一個不同意見者，又于二月三日任命周恩來為中革軍委副主席，實際上他們又剝奪了周對前線部隊的指揮權(quán)，只讓周擔(dān)負(fù)一些技術(shù)性的組織工作。大權(quán)在握的博古、李德命令紅軍處處設(shè)防，節(jié)節(jié)抵抗，推行“以碉堡對碉堡”和“短促突擊”，實行消極防御的方針，使得紅軍所進(jìn)行的許多戰(zhàn)役、戰(zhàn)斗都遭到了失敗。也就是在這種背景下，李德首次對博古說：