在“南學(xué)會(huì)”的示范、帶動(dòng)下，湖南各地各種學(xué)會(huì)如同雨后春筍般冒出來(lái)，除了“南學(xué)會(huì)”的分會(huì)，還有輿地學(xué)會(huì)、算術(shù)學(xué)會(huì)、公法學(xué)會(huì)、化學(xué)會(huì)等等。很多年后，史家張朋園在《湖南現(xiàn)代化的早期進(jìn)展》中評(píng)價(jià)湖南新政運(yùn)動(dòng)：“在政治方面提倡參與，以群策群力來(lái)發(fā)揮團(tuán)結(jié)一致的力量；在經(jīng)濟(jì)方面，力主開(kāi)發(fā)富源，以提高人民生活，增強(qiáng)社會(huì)實(shí)力；在社會(huì)方面，提倡教育，發(fā)展人民知識(shí)，主張自由平等，期望人民皆能為國(guó)家效力?！?/p>

以開(kāi)民智為宗旨的時(shí)務(wù)學(xué)堂受到光緒帝的關(guān)注，他曾夜讀時(shí)務(wù)學(xué)堂章程，并特批以湖南部分鹽稅資助經(jīng)費(fèi)。1897年8月28日，第一次招生考試，錄取學(xué)生40人，參加過(guò)那場(chǎng)考試的章士釗、楊樹(shù)達(dá)等人回憶，陳寶箴親自“監(jiān)臨收卷”，陳三立親自“校閱文卷”。當(dāng)年，黃遵憲向陳寶箴建議請(qǐng)康有為擔(dān)任長(zhǎng)沙時(shí)務(wù)學(xué)堂總教習(xí)，陳三立主張請(qǐng)梁?jiǎn)⒊?，他說(shuō)自己讀過(guò)梁的文章，“其論說(shuō)似勝于其師，不如舍康而聘梁”。最后請(qǐng)了梁。在寫(xiě)給汪康年的信中，陳三立說(shuō)自己第一次讀到《時(shí)務(wù)報(bào)》，“心氣舒豁，頓為之喜”，認(rèn)為“必能漸開(kāi)風(fēng)氣”，此前他聽(tīng)說(shuō)梁?jiǎn)⒊澳藭绱娌?，今窺一斑，益為神往矣”。事實(shí)證明，梁?jiǎn)⒊綍r(shí)務(wù)學(xué)堂講學(xué)，對(duì)湖南影響很深。無(wú)論是選學(xué)生還是請(qǐng)先生，都顯示了陳三立不尋常的見(jiàn)識(shí)。1922年，他和梁?jiǎn)⒊谀暇┲胤?，談及蔡鍔，他告訴梁，當(dāng)年蔡鍔來(lái)考時(shí)務(wù)學(xué)堂時(shí)只有十四歲，文章不通，已經(jīng)被排除在錄取名單外，是他看蔡鍔年少特別錄取的，后來(lái)果然有大成。這只是其中的一個(gè)例子。

在推行新政的過(guò)程中，阻力一直存在，1898年春天，左都御史、長(zhǎng)沙人徐樹(shù)銘在保守派的慫恿下，上疏彈劾陳寶箴、江標(biāo)、徐仁鑄等，要求責(zé)令撤換梁?jiǎn)⒊?，另外?qǐng)人主持時(shí)務(wù)學(xué)堂。6月22日，楊深秀上折（康有為代草）請(qǐng)褒揚(yáng)陳寶箴，當(dāng)天光緒稱(chēng)許陳“銳意整頓”。到7月29日，楊深秀再次上折（康有為代草）《請(qǐng)獎(jiǎng)陳寶箴折》，同日光緒帝的上諭要求陳“務(wù)必堅(jiān)持定見(jiàn)，實(shí)力舉行，慎勿為浮言所動(dòng)”，實(shí)際是督促陳不要有所退縮。

同年6月18日，陳寶箴保薦了“名位未顯，而志行可稱(chēng)，才識(shí)殊眾”的17人，其中包括楊銳、劉光弟、陳寶琛等，劉光弟與他素不相識(shí)，楊銳則是張之洞的門(mén)生。陳寶箴想不到，正是這次舉薦將為他們父子帶來(lái)災(zāi)難。當(dāng)戊戌政變的消息傳來(lái)，他并沒(méi)有意識(shí)到自己處境的危險(xiǎn)，還致電榮祿，希望能“息黨禍，維元?dú)狻薄?月24日，張蔭桓、徐致靖、楊深秀及譚嗣同、楊銳等“軍機(jī)四卿”被革職拿辦，28日“戊戌六君子”被殺。接著，張蔭桓被發(fā)配新疆。御史黃桂鎏先后兩次上折彈劾遠(yuǎn)在湖南的陳寶箴。10月6日上諭下達(dá)：“湖南巡撫陳寶箴，以封疆大吏濫保匪人，實(shí)屬有負(fù)委任，陳寶箴著即行革職永不敘用。伊子吏部主事陳三立，招引奸邪，著一并革職。”同時(shí)被革職永不敘用的還有江標(biāo)、熊希齡。據(jù)說(shuō)這已是榮祿、王文韶在慈禧太后面前苦求的結(jié)果，否則他也有發(fā)配新疆的可能。

在移交完湖南巡撫印信后，陳寶箴一家踏上了返鄉(xiāng)之路，父子“一生政治抱負(fù)，遂盡于此”。陳三立憂(yōu)國(guó)之念雖未泯滅，從此“不再與聞?wù)隆?。?dāng)年陳寅恪只有9歲。1965年與1966年，離陳寅恪生命的終點(diǎn)已近，他寫(xiě)下《寒柳堂記夢(mèng)未定稿》，對(duì)祖父和父親親歷的維新事業(yè)和悲劇命運(yùn)有過(guò)冷靜的記述。湖南新政的實(shí)績(jī)確是陳氏父子齊心協(xié)力造成，梁?jiǎn)⒊f(shuō)陳寶箴在湖南的治績(jī)“多其（指陳三立）所贊畫(huà)”。他們父子被罷黜后，有人以為陳寶箴為兒子所誤，王闿運(yùn)嘆息“江西人好聽(tīng)兒子說(shuō)話(huà)”，并從宋、明歷史中找出依據(jù)，說(shuō)王安石變法時(shí)，遇事都由兒子主持，嚴(yán)嵩當(dāng)國(guó)，也唯兒子世藩之言是從。這不過(guò)是江西人的慣例，不值得奇怪。對(duì)陳氏父子的謠言從沒(méi)有停止過(guò)，陳三立主持礦務(wù)，一位朋友謀職被拒，心懷怨望，在陳家落難后，寫(xiě)匿名信嘲諷：“翩翩濁世佳公子，不學(xué)平原學(xué)太原?！标惙蛉擞崦髟?shī)看了，微笑說(shuō)：“此二句卻佳?！标惾⒈蛔u(yù)為“晚清四公子”之一，與譚嗣同齊名。戊戌變法失敗對(duì)陳家的打擊之沉重是外人難以體會(huì)的，陳三立再也未能恢復(fù)元?dú)?。但是，有了湖南新政的那一幕，他就將永遠(yuǎn)站立在歷史中。