李鴻章在北京淪陷后才到達(dá)天津，他這時(shí)的官銜是北洋大臣、直隸總督、武衛(wèi)軍統(tǒng)帥及議和大臣，這些官銜對(duì)于八國(guó)聯(lián)軍所占領(lǐng)的天津是發(fā)生不了作用的。他之所以受洋人尊重，完全由于他個(gè)人的國(guó)際聲望。他于光緒廿六年（1900年）八月間抵達(dá)天津，幾乎是和八國(guó)聯(lián)軍統(tǒng)帥瓦德西抵津的時(shí)間相同?？墒撬麄儍扇苏揭?jiàn)面則是九月廿四日在北京會(huì)面的。

　　瓦德西事后五天曾向德皇作一詳細(xì)報(bào)告：“……余曾接見(jiàn)慶親王及總督李鴻章。李氏首先到此，慶親王剛遲廿分鐘始來(lái)；兩人共在余處計(jì)有一點(diǎn)鐘之久。從談話(huà)之中余遂覺(jué)得該兩人均有急望和議開(kāi)始之意。……李鴻章請(qǐng)命賜給彼之差官一種護(hù)照……余對(duì)于中國(guó)官?gòu)d，必須其誠(chéng)心依照余命而行者，方能容忍。今日余曾往答拜兩先生，在慶親王處僅作一番無(wú)關(guān)重要之談話(huà)，但彼要求從速開(kāi)始和平會(huì)議之意卻曾表示出來(lái)。余給李鴻章先生一圖，其上余曾劃有上述占領(lǐng)區(qū)域之范圍。李氏頗嫌其寬廣。余從李氏屢次提及進(jìn)兵張家口一事之中，可以明白盾出此舉頗使彼憂(yōu)懼，且由此足以證明余之進(jìn)兵該地可謂頗得其道?！?br/>
　　光緒廿七年（1901年）李鴻章代表清廷接受了八國(guó)聯(lián)軍所提的議和條款，這就是著名的《辛丑條約》。其要點(diǎn)為：

　　（一）中國(guó)遣使赴德日兩國(guó)道歉。

　?。ǘ娃k禍?zhǔn)状蟪肌?br/>
　　（三）禁止向中國(guó)輸入軍火兩年，期滿(mǎn)得再展延兩年。

　?。ㄋ模┵r款銀四億五千萬(wàn)兩，分卅九年償清，合利息共計(jì)銀九億八千二百余萬(wàn)兩。

　　（五）北京劃定使館區(qū)域，區(qū)內(nèi)由使館團(tuán)管理，各國(guó)并得派兵防守。

　　（六）毀大沽至北京間之炮臺(tái)。天津、北京、山海關(guān)間之交通要地，允許各國(guó)駐兵。

　　（七）清廷允許張貼“嚴(yán)禁仇外”之上諭于各地。

　　（八）清廷對(duì)任何設(shè)立仇外之會(huì)黨立刻正法。

　　這次屈辱的條約，是在聯(lián)軍槍桿下被迫簽署的；列強(qiáng)本可瓜分中國(guó)，只是由于本身間的矛盾和利害沖突，所以中國(guó)在這時(shí)候才僥幸不被瓜分，而僅被迫簽約，實(shí)在是不幸中的大幸?？墒沁@個(gè)《辛丑條約》應(yīng)該是中國(guó)有史以來(lái)對(duì)外簽定條約中的最屈辱條約，由于這個(gè)條約，使中國(guó)京城的大門(mén)洞開(kāi)，使以后幾十年的民族自尊心受到極大的打擊。

　　義和團(tuán)煙消云散，可是義和團(tuán)事件的影響，卻極其深遠(yuǎn)：

　　（一）世界各國(guó)并不去檢討這次事件形成的原因，而嚴(yán)厲指責(zé)義和團(tuán)行動(dòng)粗暴，指責(zé)中國(guó)不是一個(gè)文明國(guó)家，指責(zé)中華民族是一個(gè)野蠻的民族。

　?。ǘ┳曾f片戰(zhàn)爭(zhēng)開(kāi)始，西洋武力開(kāi)始侵略中國(guó)，但每次戰(zhàn)爭(zhēng)它們所擊敗的只是清朝政府，一般民眾和守舊士大夫，在心理上并未屈服。義和團(tuán)事件是清朝政府、中國(guó)衛(wèi)道的士大夫、以及廣大的農(nóng)民匯合凝聚而成的力量，他們以符咒和拳棒去和西洋槍炮相對(duì)抗，結(jié)果徹底地失敗了。經(jīng)過(guò)這次慘敗，清朝野都都不敢輕外仇外，民族自尊心完全喪失，人民在不知不覺(jué)中養(yǎng)成了媚外心理，這種心理影響了中國(guó)以后數(shù)十年。

　?。ㄈ┒綋釞?quán)力增加，演變成后來(lái)軍閥割據(jù)。因?yàn)槿兤陂g，李鴻章、劉坤一、袁世凱等人和列強(qiáng)約定，各省自保。保護(hù)外人生命財(cái)產(chǎn)和教堂，請(qǐng)列強(qiáng)勿進(jìn)兵東南各省，這一舉措在拳變之后受到清廷的承認(rèn)和嘉勉，遂使各省督撫形成半獨(dú)立局面。

　　（四）中國(guó)有志之士認(rèn)清一點(diǎn)：就是腐化的清朝政權(quán)，非推翻不可，欲救中國(guó)，非革命不可。

　?。ㄎ澹┳蠲黠@的結(jié)果，是清朝政府中老的一代死的死，被淘汰的淘汰了，眾望所歸的唯一人物是袁世凱，他取代了李鴻章的地位，從而為未來(lái)的北洋軍閥一系奠定基礎(chǔ)。

　　袁世凱在義和團(tuán)之變時(shí)，不僅成為有名望的督撫，堪與劉坤一、張之洞等齊名。且由于他在北方，各省督撫向北京的奏報(bào)都是由他轉(zhuǎn)遞，加上義和團(tuán)肇始山東，自袁接任山東巡撫后，山東省境內(nèi)太平，因此無(wú)論中外人士對(duì)袁都刮目相看了。

　　北京陷后，兩宮出奔，在蒙塵途中曾電諭李鴻章，命他火速前往北京與洋人議和。袁亦密電李鴻章說(shuō)：“海關(guān)總稅務(wù)司赫德稱(chēng)，各國(guó)并無(wú)他意，深盼李相能說(shuō)慶親王共商議和事?！?br/>
　　如此一來(lái)，袁對(duì)國(guó)家大事，也取得了發(fā)言權(quán)了。

　　慈禧和光緒在赴西安途中，追隨左右的全是守舊派大臣，由于這些頑固派的包圍，所以談和時(shí)，洋人也心存疑慮，因此袁和李鴻章便密商促成榮祿能盡速前往行在，俾慈禧左右能有一進(jìn)言之大臣。榮祿在北京失陷時(shí)，對(duì)于守舊派壟斷朝政，深感灰心，經(jīng)李、袁的敦促，乃趨赴西安。而慈嬉對(duì)榮祿仍極信任，不久榮祿便成為極重要的軍機(jī)大臣。自榮祿重被慈禧所寵信，袁的發(fā)言權(quán)便大為提高。在這期間，他和劉坤一、張之洞、盛宣懷等聯(lián)成一氣，而李鴻章在北京，榮祿在西京，因此他的意見(jiàn)可以四通八達(dá)，他的地位便日益重要了。

　　當(dāng)和議達(dá)成，八國(guó)聯(lián)軍即將撤兵時(shí)，京畿重地必須有清兵駐守，以維治安，李鴻章急電請(qǐng)?jiān)山痤}率兵先赴河南，以備接替。當(dāng)時(shí)姜桂題正在保護(hù)青濰鐵道工程，袁于是即撥防營(yíng)前往遞補(bǔ)，并飭姜桂題立即出發(fā)，待命前往接替八國(guó)聯(lián)軍。

　　光緒廿七年（1901年）四月廿九日袁世凱的親生母親劉氏病逝。原來(lái)劉氏和袁的嗣母牛氏都是住在河南項(xiàng)城原籍，牛氏去世后，袁乃迎養(yǎng)親生母到住所，隨袁宦游各地，主持家務(wù)。袁丁喪后遂電辭山東巡撫，可是他這時(shí)候是各方所矚目的大臣，山東全身司道百官和地方紳士，都紛電西安行在和李鴻章處，請(qǐng)旨奪情。五月一日上諭給袁喪假一百天，袁有哀懇電云：“五月初一日恭奉諭旨，以世凱丁本生母憂(yōu)，賞假百日，即在撫署穿孝，假滿(mǎn)后改為署理，照常任事。捧讀之余，感紉泣血，伏念時(shí)勢(shì)阽危，至今已極。聯(lián)軍尚未盡撤，伏莽益復(fù)橫行，臣母病中，時(shí)勖臣以損頂摩踵仰酬知遇，并以病軀支離，未得親見(jiàn)回鑾盛典為詞。迨至彌留之際，口不能言，猶復(fù)舉手西指，淚滿(mǎn)衣襟，是臣上報(bào)君恩，似未可一意固辭，下承母訓(xùn)，尤不愿再三虛讓。惟是窀穸未安，方寸已亂，設(shè)身膺墨，而手惓簿書(shū)，非但為千古之罪人，亦恐負(fù)一時(shí)之清議。傍徨午夜，屢絕粥饘?zhuān)瑧?zhǔn)百日內(nèi)開(kāi)缺離署，扶櫬返里，俟葬親事畢，遄返東省，當(dāng)專(zhuān)任營(yíng)務(wù)，稍盡翊衛(wèi)巡防之任。倘冬春之交，時(shí)局大定，再懇許臣回籍終制，此則烏哺私情，以必得所求而后已也?！蔽逶率蝗沾褥麥刂嘉苛簦瑫r(shí)派員代表太后賜祭。

　　袁的生母劉氏和嗣母牛氏本是妯娌，她們都是舊社會(huì)婦女，受的全是舊禮教薰陶，兩妯娌對(duì)于這個(gè)能干兒子都很寵愛(ài)。袁在山東巡撫任內(nèi)雖為時(shí)只有一兩年，但他已成全國(guó)矚目人物，項(xiàng)城袁家的人很多都濟(jì)南，而袁也大力整修項(xiàng)城的舊居。劉太夫人一直隨袁在濟(jì)南，劉氏物故后，袁一再懇辭山東巡撫以守制三年，這不過(guò)是舊中國(guó)的禮教習(xí)慣，其實(shí)袁這時(shí)不止是辭卸不得，而且好運(yùn)還才開(kāi)始呢！

　　袁在山東巡撫任內(nèi)有一件新政，就是在省城濟(jì)南設(shè)置大學(xué)堂。不過(guò)這所謂的大學(xué)堂，是小學(xué)、中學(xué)、大學(xué)的一貫制，共分四級(jí)，第一級(jí)稱(chēng)“蒙養(yǎng)學(xué)堂”，挑選幼童自七歲起至14歲止，為時(shí)八年，講習(xí)經(jīng)史，并授以簡(jiǎn)易天文、地輿、算術(shù)。畢業(yè)后升入第二級(jí)稱(chēng)“備齋”，講求淺近政治、藝學(xué)，兩年畢業(yè)。畢業(yè)后升入第三級(jí)“正齋”，研讀四年，分科為中國(guó)經(jīng)學(xué)、中外史學(xué)、中外政治學(xué)、方言學(xué)、商學(xué)、工學(xué)、礦學(xué)、農(nóng)學(xué)、測(cè)繪學(xué)、醫(yī)學(xué)共十門(mén)。畢業(yè)后升入“專(zhuān)齋”，以?xún)赡曛了哪隇槠?。?zhuān)齋課程俟正齋畢業(yè)后再訂。每年經(jīng)費(fèi)預(yù)算6萬(wàn)兩，聘美國(guó)人赫士為總教習(xí)。這就是最早的山東大學(xué)堂，后來(lái)雖然未照這計(jì)劃進(jìn)行，可是，袁總算是一個(gè)首創(chuàng)者。

　　中國(guó)士大夫階級(jí)都有濃厚的重農(nóng)輕商觀念，袁則認(rèn)識(shí)商業(yè)發(fā)達(dá)，可以富國(guó)裕民，所以他在山東農(nóng)商并重，因此首創(chuàng)商務(wù)總局，以道員唐紹儀總司局務(wù)。又設(shè)籌款總局，整飭土藥、煙酒各項(xiàng)雜稅厘捐。并且派遣道員馬廷亮往日本搜集日本銀行鑄造銀圓的辦法和章程，以及印刷鈔票的辦法等等。

　　事實(shí)上，這個(gè)時(shí)候的袁世凱，所有措施都算得上是新政，正因?yàn)樗切抡?，和守舊的頑固派對(duì)比，顯得突出，政治是多么的現(xiàn)實(shí)，他當(dāng)年以出賣(mài)維新派、打倒新政而鴻運(yùn)當(dāng)頭，如今他卻以行新政而贏取時(shí)譽(yù)。

　　袁曾得意地告訴幕僚們說(shuō)：“此次拳亂，各督撫中如無(wú)我輩四人搘拄，國(guó)事尚可問(wèn)乎？”袁所謂的四人是：李鴻章、劉坤一、張之洞和他自己，得意之情，溢于言表。

　　光緒廿七年（1901年）九月廿六日，西太后和光緒皇帝以及王公大臣正在回往北京途中，這天是由河南省鞏縣抵達(dá)汜水縣駐蹕，得到李鴻章自京電奏：“病勢(shì)危篤，請(qǐng)速派大臣接替，以資鎮(zhèn)攝?！边@時(shí)奕劻已由北京前來(lái)迎駕，俾讓兩宮在還京以前詳知談和情形以及北京近況，李鴻章突然病重，所以電奏兩宮，希望速讓奕劻趕返北京，繼續(xù)和議。慈禧和光緒閱電都非常擔(dān)心，因?yàn)檗葎岭m已出京，但尚未趕到。慈禧這天以極憂(yōu)郁的顏色對(duì)隨駕的吳永說(shuō)：“大局未定，李相倘有不測(cè)，這如此重荷，更有何人可以分擔(dān)？”

　　第二天，九月廿七日兩宮自汜水赴榮陽(yáng)，傍晚接到北京急電，李鴻章于午刻逝世，慈禧和光緒聽(tīng)見(jiàn)這個(gè)噩耗，飯都吃不下去，隨駕大臣乃至宮監(jiān)衛(wèi)士都有梁傾棟折的感覺(jué)。慈禧和光緒立即召見(jiàn)榮祿等大臣，太后決定三個(gè)主要人事命令：

　　一、王文韶著署理全權(quán)大臣。

　　二、直隸總督兼北洋大臣著袁世凱署理；未到任以前，著周馥護(hù)理。

　　三、山東巡撫著漕運(yùn)總督張人駿調(diào)補(bǔ)。

　　十月初二日兩宮駐蹕開(kāi)封，河南全省文武均在城外迎駕，行宮陳設(shè)壯麗，儼然有內(nèi)廷氣象。奕劻由京師趕到，立即獲得召見(jiàn)，詢(xún)問(wèn)京中情況至為詳盡。第二天再召奕劻，奕劻把李鴻章的最后奉疏奉呈，兩宮都為之流涕。

　　李鴻章的遺疏全文于后：

　　奏為臣病垂危，自知不起，口占遺疏，仰求圣鑒事。竊臣體氣素健，向能耐勞，服官四十余年，未嘗因病請(qǐng)假。前在馬關(guān)受傷，流血過(guò)久，遂成眩暈。去夏冒暑北上，復(fù)患泄瀉，元?dú)獯髠?。入都后又以事機(jī)不順，朝夕焦思，往往徹夜不眠，胃納日減，觸發(fā)舊疾時(shí)作時(shí)止。迭蒙圣慈垂詢(xún)，特賞假期，慰諭周詳，感激涕零。和約幸得竣事，俄約仍無(wú)定期，上貽宵旰之憂(yōu)，是臣未終心事。每一念及，憂(yōu)灼五中。本月十九夜，，忽喀血碗余，數(shù)日之間，遂至沉篤，群醫(yī)束手，知難久延。謹(jǐn)口占遺疏，煩臣子經(jīng)述恭校寫(xiě)成，固封以俟。伏念臣受知最早，蒙恩最深，每念時(shí)局艱危，不敢自稱(chēng)衰病。惟冀稍延余息，重睹中興。赍志以終，歿身難瞑?，F(xiàn)值京師初復(fù)，鑾輅未歸，和議新成，東事尚棘，根本至計(jì)，處處可虞。竊念多難興邦，殷憂(yōu)啟圣。伏讀迭次諭旨，舉行新政，力圖自強(qiáng)。慶親王等皆臣久經(jīng)共事之人，此次復(fù)同更患難，定能一心效力，翼贊訐謨。臣在九泉，庶無(wú)遺憾。至臣子孫，皆受?chē)?guó)厚恩，唯有勖其守身讀書(shū)，勉圖報(bào)效。屬纊在即，瞻望無(wú)時(shí)，長(zhǎng)辭圣明，無(wú)任依戀之至。謹(jǐn)叩謝天恩，乞皇太后、皇上圣鑒。謹(jǐn)奏。

　　同日發(fā)布一道上諭：“奉懿旨，略謂上年京師之變，該大學(xué)士忠誠(chéng)堅(jiān)忍，力任其難，宗社復(fù)安，朝廷攸賴(lài)。近日因病，然經(jīng)降旨慰問(wèn)，該大學(xué)士力疾從公，忠靖之忱，老而彌篤。乃驟患咯血，遽爾不起，艱危之交，失此柱石重臣，曷勝愴慟！前已加恩云云。著再賞銀五千兩治喪，立功省分建立專(zhuān)祠；政功戰(zhàn)績(jī)，宣付史館。伊子李經(jīng)述，著賞給四品京堂，承襲一等侯爵；李經(jīng)邁著以四品京堂用；李經(jīng)方服闋后以道員遇缺簡(jiǎn)放。伊孫李國(guó)杰，著以郎中即補(bǔ)；李國(guó)燕、李國(guó)煦著以員外郎分部行走；李國(guó)能、李國(guó)燾著賞給舉人，一體會(huì)試云云?！?br/>
　　初四、初五、初六均在開(kāi)封逐日召見(jiàn)奕劻，并于初五日頒上諭：“奉懿旨，奕劻著加恩在紫禁城內(nèi)乘坐二人肩輿?！背趿彰葎羻⒊谭稻├^續(xù)辦理議和以及準(zhǔn)備兩宮回京事宜。

　　李鴻章的去世，使袁世凱成為北洋正統(tǒng)的領(lǐng)導(dǎo)人，成為當(dāng)時(shí)最重要的人物，雖然光緒對(duì)袁的擢升很不開(kāi)心，可是這是慈禧的主意，光緒如何可以反對(duì)呢。

　　袁世凱出任北洋大臣和直隸總督，雖由慈禧決定，有人卻說(shuō)是李鴻章遺奏保薦，又有人說(shuō)是軍機(jī)大臣榮祿向太后力薦。不管是誰(shuí)的保薦，問(wèn)題在于慈禧對(duì)袁有好感，信任他的忠實(shí)，欣賞他的才干，使袁以一個(gè)普通的道員，在五六年時(shí)間便爬到督撫地位，更特別的是直隸總督簡(jiǎn)直等于督撫團(tuán)領(lǐng)袖，擔(dān)負(fù)拱衛(wèi)中樞的重大責(zé)任。

　　相傳李鴻章臨死前有遺折奏保袁為繼任人，但在《文忠集》內(nèi)卻無(wú)此奏稿。同時(shí)袁的任命是在兩宮回鑾途中得李去世電的第二天即降旨，所以李縱使有遺折薦袁自代，可是袁的大命卻是直接出于慈禧的圣眷。

　　袁因有李的遺疏薦賢的傳說(shuō)，愈發(fā)見(jiàn)重于世，據(jù)說(shuō)代李擬稿的是于式枚（號(hào)晦若）。薦袁是用“附片”，附片也是清朝一種官書(shū)，遇有機(jī)密，謄之附片上達(dá)，可以留中不發(fā)。附片中有句：“環(huán)顧宇內(nèi)人才，無(wú)出袁世凱右者?！痹髞?lái)有致于式枚一函，答謝于代李草疏薦己，函云：

　　“……節(jié)相騎箕，天下共慟！弟識(shí)陋望淺，何敢作此替人？乃承示以疏稿，竟過(guò)許：‘環(huán)顧宇內(nèi)人才，無(wú)出世凱右者！’此雖出節(jié)相之口授，實(shí)亦由足下之成，弟當(dāng)詔示子孫，永銘大德。茲隨函奉上古董八件（另附一單于函末），戔戔聊表謝忱?！?br/>
　　這一年袁世凱43歲，與當(dāng)時(shí)的有名望的大臣和督撫比，實(shí)在太年輕了；因?yàn)樗娜磺叭?，榮祿已快70歲，李鴻章79歲，王文韶68歲，袁世凱的年齡足夠做這三位前任總督的兒子。

　　袁奉命署理直隸總督后，由于喪服在身，所以堅(jiān)辭朝命，慈禧不許，于是他先把左右的人事作了一番部署，副將張勛、守備孟恩遠(yuǎn)、都司曹錕、吳鳳嶺等都蒙奏薦嘉獎(jiǎng)，又特疏保薦唐紹儀。唐自朝鮮起便一直追隨老袁，袁在山東巡撫任內(nèi)曾創(chuàng)設(shè)商務(wù)總局，唐紹儀便以道員總攬局務(wù)，擬定各項(xiàng)規(guī)則，辦理頗有成效，可算是袁的左右手。

　　光緒廿七年（1901年）十月初十日，袁世凱一切安排都已就緒，乃把山東巡撫篆務(wù)交給護(hù)理巡撫布政使胡廷幹，然后于十一日自山東起程北上，唐紹儀隨行。十月十六日抵河北高陽(yáng)，直隸護(hù)理總督周馥派人捧直隸總督大印來(lái)迎。十七日袁接收印綬，即日履任視事。

　　袁接任后的第一道人事命令，是派唐紹儀為津海關(guān)道。唐深通洋務(wù)，在朝鮮時(shí)也是主辦關(guān)務(wù)。還有一個(gè)巧合，護(hù)理總督周馥在十五六年前也是任津海關(guān)道，那時(shí)袁在朝鮮，便和周訂交，甚為莫逆。周馥一直在直隸省任職，后來(lái)做直隸臬司，最后是直隸按察使。他是按步就班地往上爬，而他的老朋友卻出將入督，不過(guò)幾年時(shí)光已變成著名的督撫，并且回到直隸做他的頂頭上司了。

　　當(dāng)袁奉派為直隸總督兼北洋大臣后，兩宮在開(kāi)封行宮于九月廿八日再頒上諭：“奉懿旨，以回鑾在即，頒賞有功人員，李鴻章再賜祭一壇，伊子李經(jīng)邁以三四品京堂候補(bǔ)；慶親王奕劻賞食親王雙俸；大學(xué)士榮祿賞戴雙眼花翎，并加太子太保銜；王文韶賞戴雙眼花翎；兩江總督劉坤一，加太子太保銜；湖廣總督張之洞，直隸總督袁世凱，均加太子少保銜；余如聯(lián)芳、那桐、張翼、周馥等，均升賞有差”。其后三天又頒上諭：“盛宣懷、赫德均賞加太子少保銜”。

　　袁在直隸任內(nèi)第一件參奏，是請(qǐng)兩宮懲辦此次肇變禍?zhǔn)?，將董福祥明正典刑。袁?duì)董的恩怨，一方面由于董在武衛(wèi)軍時(shí)代以助義和團(tuán)而恣意胡為，同時(shí)因董在不久前曾向榮祿威脅，袁這一奏疏使榮祿最為滿(mǎn)意。