ggplot2科技繪圖：基于R語言的數(shù)據(jù)可視化

第1章　R語言基礎1
1.1　R語言概述1
1.1.1　R語言的誕生1
1.1.2　R語言的特點2
1.1.3　R語言繪圖系統(tǒng)2
1.1.4　圖形語法3
1.2　搭建R語言環(huán)境4
1.2.1　安裝程序的下載4
1.2.2　R語言的安裝與啟動6
1.2.3　輔助工具Rstudio8
1.2.4　包的安裝與加載10
1.3　對象與變量14
1.3.1　對象14
1.3.2　變量15
1.4　數(shù)據(jù)結構16
1.4.1　數(shù)據(jù)類型16
1.4.2　向量18
1.4.3　矩陣與數(shù)組22
1.4.4　數(shù)據(jù)框24
1.4.5　列表27
1.4.6　因子29
1.5　基本運算30
1.6　獲取幫助信息32
1.6.1　使用內置幫助函數(shù)32
1.6.2　獲取自帶數(shù)據(jù)集信息33
1.6.3　R語言相關軟件和資料34
1.7　本章小結34
第2章　數(shù)據(jù)基本操作35
2.1　管道操作35
2.2　數(shù)據(jù)存取38
2.2.1　讀入R格式數(shù)據(jù)38
2.2.2　讀取CSV/TXT格式數(shù)據(jù)40
2.2.3　讀取Excel格式數(shù)據(jù)42
2.2.4　保存數(shù)據(jù)43
2.3　數(shù)據(jù)連接44
2.3.1　merge()函數(shù)44
2.3.2　cbind()函數(shù)與
rbind()函數(shù)45
2.3.3　dplyr包的連接函數(shù)47
2.4　數(shù)據(jù)抽樣49
2.4.1　生成隨機數(shù)49
2.4.2　隨機抽樣50
2.4.3　系統(tǒng)抽樣50
2.4.4　分層抽樣51
2.5　數(shù)據(jù)塑形55
2.5.1　寬數(shù)據(jù)轉換為長數(shù)據(jù)55
2.5.2　長數(shù)據(jù)轉換為寬數(shù)據(jù)58
2.5.3　分割列60
2.5.4　合并列62
2.6　缺失值與空值處理63
2.6.1　缺失值63
2.6.2　空值66
2.7　本章小結68
第3章　ggplot2繪圖系統(tǒng)69
3.1　基本語法69
3.1.1　ggplot2語法框架70
3.1.2　數(shù)據(jù)和圖形屬性映射72
3.1.3　創(chuàng)建幾何對象76
3.1.4　添加統(tǒng)計變換84
3.2　坐標系統(tǒng)88
3.2.1　笛卡兒坐標系88
3.2.2　極坐標系90
3.2.3　地理坐標系91
3.3　圖形分面93
3.4　標度函數(shù)96
3.4.1　顏色標度函數(shù)97
3.4.2　坐標標度函數(shù)104
3.5　主題函數(shù)113
3.6　保存圖形118
3.7　本章小結118
第4章　注釋與頁面布局119
4.1　添加注釋119
4.1.1　添加文本注釋120
4.1.2　通過嵌套為圖形做注釋123
4.1.3　為坐標軸添加對數(shù)
刻度線124
4.2　頁面布局126
4.2.1　利用patchwork包126
4.2.2　利用gridExtra包131
4.3　本章小結134
第5章　創(chuàng)建基本圖表135
5.1　散點圖135
5.2　折線圖140
5.3　柱狀圖143
5.4　階梯圖150
5.5　等高線圖152
5.6　核密度圖155
5.7　面積圖160
5.8　頻率多邊圖162
5.9　柵格圖164
5.10　本章小結168
第6章　創(chuàng)建統(tǒng)計圖表169
6.1　直方圖169
6.2　二維直方圖172
6.3　箱線圖175
6.4　小提琴圖181
6.5　分組點圖184
6.6　添加誤差條188
6.7　本章小結193
第7章　添加幾何元素到圖表194
7.1　指定參考線194
7.2　添加隨機抖動197
7.3　平滑線200
7.4　垂直線203
7.5　帶狀圖205
7.6　區(qū)間線段207
7.7　多邊形209
7.8　文本標簽211
7.9　邊緣短線214
7.10　空幾何對象216
7.11　本章小結218
第8章　統(tǒng)計變換繪圖219
8.1　繪制直方圖和頻率折線圖219
8.2　繪制條形圖222
8.3　繪制密度曲線224
8.4　繪制置信橢圓227
8.5　繪制等高線圖229
8.6　繪制箱線圖231
8.7　添加平滑曲線234
8.8　繪制經(jīng)驗累積分布函數(shù)圖237
8.9　繪制Q-Q圖239
8.10　繪制分位數(shù)線242
8.11　繪制數(shù)學函數(shù)圖244
8.12　繪制重復點數(shù)量圖246
8.13　繪制數(shù)據(jù)中的唯一值249
8.14　顯示原始數(shù)據(jù)251
8.15　其他統(tǒng)計變換函數(shù)253
8.16　本章小結255
第9章　標度256
9.1　標度概述256
9.2　顏色標度257
9.2.1　顏色標度函數(shù)匯總257
9.2.2　調色板參數(shù)設置260
9.2.3　RColorBrewer調色板262
9.3　坐標標度266
9.4　透明度標度268
9.5　點形狀標度272
9.6　點大小/線粗細標度275
9.7　線型標度278
9.8　線寬標度281
9.9　本章小結284
第10章　拓展包ggpubr285
10.1　ggpubr概述285
10.2　快速創(chuàng)建圖表288
10.2.1　點圖288
10.2.2　散點圖290
10.2.3　密度圖293
10.2.4　箱線圖295
10.2.5　小提琴圖297
10.2.6　直方圖299
10.2.7　便捷繪圖函數(shù)匯總302
10.3　添加統(tǒng)計標記307
10.3.1　添加回歸線和
相關系數(shù)308
10.3.2　添加顯著性標記309
10.3.3　手動添加顯著性
標記313
10.3.4　添加統(tǒng)計標記函數(shù)
匯總315
10.4　圖形美化和調整316
10.4.1　排列多幅圖316
10.4.2　調整圖例、標題和
坐標軸標簽318
10.4.3　添加注釋和文本321
10.4.4　導出圖形323
10.5　本章小結326
第11章　其他拓展包327
11.1　主題包（ggthemes）327
11.2　峰巒圖（ggridges）330
11.3　水平條形圖（ggHoriPlot）332
11.4　相關矩陣圖（ggcorrplot）338
11.5　添加統(tǒng)計注釋（ggstatsplot）340
11.6　生存分析（ggsurvfit）347
11.7　蜂群圖（ggbeeswarm）351
11.8　跟蹤點/線（ggtrace）353
11.9　馬賽克圖（ggmosaic）357
11.10　本章小結360