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內(nèi)容簡介

　　隨著高通量測(cè)序技術(shù)在傳染病防控中的廣泛應(yīng)用，基層工作中亟需具有實(shí)操指導(dǎo)性的高通量測(cè)序技術(shù)專業(yè)書籍。本書兼顧理論與實(shí)踐，圖文結(jié)合，圍繞基因測(cè)序（濕實(shí)驗(yàn)）、數(shù)據(jù)分析（干實(shí)驗(yàn)）兩部分核心內(nèi)容展開論述：前者涵蓋基因發(fā)展概述、測(cè)序原理、測(cè)序?qū)嶒?yàn)室&儀器、測(cè)序操作等內(nèi)容，覆蓋基因測(cè)序重點(diǎn)核心步驟，可為實(shí)驗(yàn)室建設(shè)提供指引、為實(shí)驗(yàn)室操作提供參考等；后者包括數(shù)據(jù)分析基礎(chǔ)概念、流程與原理、常用數(shù)據(jù)庫&軟件等，滿足讀者入門及基礎(chǔ)分析要求。

作者簡介

　　陳恒，博士，副主任技師，成都市疾控中心腸道病毒負(fù)責(zé)人，中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院成都新發(fā)突發(fā)傳染病防治工作站基因測(cè)序平臺(tái)負(fù)責(zé)人。趙翔，碩士，博士在讀。世界衛(wèi)生組織全球流感參比和合作研究中心，國家流感中心，測(cè)序及新技術(shù)平臺(tái)負(fù)責(zé)人。崔侖標(biāo)，博士，研究員，博士生導(dǎo)師。江蘇省疾病預(yù)防控制中心病原微生物研究所所長。

圖書目錄

目錄

第一章高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展與應(yīng)用1

第一節(jié)測(cè)序技術(shù)概述2

第二節(jié)測(cè)序技術(shù)的發(fā)展10

第三節(jié)高通量測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用13

第二章高通量測(cè)序原理17

第一節(jié)Illumina測(cè)序原理17

第二節(jié)華大MGI測(cè)序原理23

第三節(jié)Ion Torrent測(cè)序原理27

第四節(jié)ONT測(cè)序原理31

第五節(jié)PacBio單分子實(shí)時(shí)測(cè)序原理33

第六節(jié)GenapSys測(cè)序原理34

第三章高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)37

第一節(jié)DNA測(cè)序37

第二節(jié)RNA測(cè)序46

第三節(jié)DNA甲基化測(cè)序55

第四節(jié)宏基因組測(cè)序63

第四章基因測(cè)序流程69

第一節(jié)實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)及注意事項(xiàng)69

第二節(jié)濕實(shí)驗(yàn)70

第三節(jié)干實(shí)驗(yàn)84

第五章生物信息學(xué)分析85

第一節(jié)生物信息學(xué)概述85

第二節(jié)生物信息學(xué)分析流程91

第三節(jié)新型冠狀病毒NGS的數(shù)據(jù)分析99

第六章生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫110

第一節(jié)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的分類110

第二節(jié)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫的發(fā)展112

第三節(jié)主要數(shù)據(jù)庫簡介113

第七章生物信息學(xué)工具包132

第一節(jié)商業(yè)軟件及應(yīng)用指導(dǎo)132

第二節(jié)在線分析網(wǎng)站（以新型冠狀病毒為例）154