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內(nèi)容簡(jiǎn)介

　　抗病基因?qū)χ参锏纳L發(fā)育起著非常重要的免疫調(diào)控作用，植物中抗病基因的數(shù)量和特征對(duì)該植物的抗病機(jī)制研究至關(guān)重要。本書選擇禾本科植物二穗短柄草作為研究對(duì)象，系統(tǒng)鑒定了該物種內(nèi)最重要的一類抗病基因家族，這類抗病基因所編碼的蛋白具有核苷酸結(jié)合結(jié)構(gòu)域（NBS，Nucleotide Binding Site）和亮氨酸重復(fù)結(jié)構(gòu)域（LRR，Leucine—Rich Repeats），并系統(tǒng)分析了這些抗病基因。在獲得二穗短柄草中的NBS一LRR抗病基因列表后，繼續(xù)研究了其數(shù)字序列特征，并應(yīng)用機(jī)器學(xué)習(xí)中的支持向量機(jī)算法對(duì)這些特征進(jìn)行訓(xùn)練建模，構(gòu)建和優(yōu)化后的機(jī)器學(xué)習(xí)模型，可實(shí)現(xiàn)對(duì)其他已測(cè)序物種的快速抗病基因鑒定。本書可供基因分析及機(jī)器預(yù)測(cè)學(xué)習(xí)方法研究人員參考。

作者簡(jiǎn)介

暫缺《二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機(jī)器學(xué)習(xí)預(yù)測(cè)方法研究》作者簡(jiǎn)介

圖書目錄

1 緒論
1.1 植物抗病基因概述
1.2 植物抗病基因研究中的生物信息學(xué)
1.3 常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析軟件
1.4 本書的技術(shù)線路圖
1.5 本書的主要內(nèi)容
1.6 本書的目的和意義
2 二穗短柄草抗病基因家族NBS.LRR的鑒定與生物信息學(xué)
分析
2.1 引言及研究動(dòng)機(jī)
2.2 數(shù)據(jù)與方法
2.3 結(jié)果與分析
2.4 討論與小結(jié)
3 二穗短柄草NBS.LRR抗病基因家族的表達(dá)譜分析
3.1 引言及研究動(dòng)機(jī)
3.2 基因表達(dá)譜分析的常用技術(shù)
3.3 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的獲取
3.4 結(jié)果與分析
3.5 討論與小結(jié)
4 NBS—LRR基因家族預(yù)測(cè)算法的設(shè)計(jì)與應(yīng)用
4.1 研究背景
4.2 方法與數(shù)據(jù)集
4.3 結(jié)果與分析
5 總結(jié)與展望
5.1 主要研究結(jié)果
5.2 創(chuàng)新點(diǎn)
5.3 展望
附錄
附錄l 縮略詞簡(jiǎn)表
附錄2 NBS—LRR抗病基因列表
附錄3 二穗短柄草中我們鑒定出的126個(gè)典型的NBS—LRR抗病基因的蛋白序列
附錄4 NBS一LRR抗病基因的基因簇分布
附錄5 氨基酸的部分理化性質(zhì)簡(jiǎn)表
附錄6 擬南芥中的正負(fù)樣本序列列表
附錄7 NBS—LRR抗病基因的蛋白序列結(jié)構(gòu)域特征
參考文獻(xiàn)