海洋生物功能基因開發(fā)與利用

叢書序
序言
前言
第一章 概述
第一節(jié) 基因與基因資源
一、基因的基本概念
二、基因資源的特性
三、功能基因的發(fā)掘利用
第二節(jié) 海洋生物功能基因與基因資源
一、海洋生物基因資源的特點
二、海洋生物基因資源研究現(xiàn)狀
三、海洋生物功能基因開發(fā)利用
主要參考文獻
第二章 海洋生物功能基因發(fā)掘與驗證技術(shù)
第一節(jié) 基因組學(xué)技術(shù)
一、基因組調(diào)查
二、普通基因組圖譜
三、復(fù)雜基因組圖譜
第二節(jié) 轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)
一、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)平臺
二、基于高通量測序的轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)
三、轉(zhuǎn)錄組研究其他技術(shù)
四、單細胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)
五、非編碼RNA研究技術(shù)
第三節(jié) 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)
一、簡介
二、研究進展及應(yīng)用實例
三、展望及發(fā)展趨勢
第四節(jié) 宏基因組學(xué)技術(shù)
一、宏基因組學(xué)起源
二、宏基因組學(xué)在海洋微生物研究中的應(yīng)用
第五節(jié) 海洋生物功能基因驗證技術(shù)
一、功能基因的結(jié)構(gòu)特征分析與功能預(yù)測
二、基因表達規(guī)律分析技術(shù)
三、基于基因功能獲得與失活策略的研究技術(shù)
四、基于基因編碼產(chǎn)物與蛋白質(zhì)或核酸相互作用的研究技術(shù)
主要參考文獻
第三章 海洋生物功能基因開發(fā)利用技術(shù)
第一節(jié) 海洋生物基因功能產(chǎn)品——天然產(chǎn)物
一、簡介
二、研究進展及應(yīng)用實例
三、展望及趨勢
第二節(jié) 海洋生物藥用功能基因開發(fā)
一、概述
二、國內(nèi)外研發(fā)現(xiàn)狀與趨勢
三、發(fā)展前景
第三節(jié) 海洋生物抗菌肽的研究與利用
一、簡介
二、研究進展及應(yīng)用實例
三、展望及趨勢等
第四節(jié) 海洋生物基因功能產(chǎn)品——工業(yè)用品
一、概念、原理和技術(shù)
二、海洋生物基因工業(yè)產(chǎn)品的研究進展
三、展望
第五節(jié) 系統(tǒng)發(fā)育學(xué)及DNA條形碼
一、系統(tǒng)發(fā)育學(xué)
二、DNA條形碼
第六節(jié) 海洋環(huán)境污染監(jiān)測技術(shù)及病原檢測技術(shù)
一、海洋環(huán)境污染監(jiān)測技術(shù)及病原檢測技術(shù)簡介
二、研究進展及應(yīng)用實例
三、展望及趨勢
主要參考文獻
第四章 海洋動物功能基因的發(fā)掘和利用
第一節(jié) 海洋生物基因組進展
一、海洋魚類
二、海洋鳥類
三、海洋爬行動物
四、海洋哺乳動物
五、其他海洋生物
六、總結(jié)與展望
第二節(jié) 半滑舌鰨
一、簡介
二、半滑舌鰨基因組研究進展
三、半滑舌鰨重要性狀相關(guān)功能基因發(fā)掘研究進展
第三節(jié) 牙鲆
一、簡介
二、全基因組測序及精細圖譜繪制研究進展
三、功能基因發(fā)掘利用研究進展及展望
第四節(jié) 石斑魚
一、石斑魚簡介
二、斜帶石斑魚基因組研究進展
三、石斑魚功能基因挖掘與利用研究進展
四、展望
第五節(jié) 彈涂魚
一、彈涂魚簡介
二、彈涂魚的兩棲習(xí)性
三、彈涂魚基因組學(xué)研究進展
四、彈涂魚呼吸和體內(nèi)離子平衡研究
五、彈涂魚附肢的特化
六、總結(jié)與展望
第六節(jié) 大黃魚
一、大黃魚免疫系統(tǒng)特征
二、大黃魚免疫相關(guān)基因研究
第七節(jié) 海馬
一、海馬簡介
二、海馬基因組及功能基因研究進展
三、海馬功能基因研究展望
第八節(jié) 菊黃東方純
一、簡介
二、基因組及功能基因研究進展
三、功能基因發(fā)掘利用
第九節(jié) 中國明對蝦
一、簡介
二、中國明對蝦功能基因及基因組研究進展
三、中國明對蝦功能基因研究的應(yīng)用前景
第十節(jié) 凡納濱對蝦
一、簡介
二、凡納濱對蝦功能基因及基因組研究進展
三、凡納濱對蝦功能基因和基因組研究在生產(chǎn)中的應(yīng)用
第十一節(jié) 牡蠣
一、牡蠣全基因組測序
二、生長發(fā)育基因與應(yīng)用展望
三、貝殼形成相關(guān)功能基因與應(yīng)用展望
四、牡蠣抗逆相關(guān)基因的篩選及應(yīng)用前景
第十二節(jié) 扇貝
一、扇貝全基因組序列圖譜組裝及質(zhì)量評估
二、扇貝基因組注釋及結(jié)構(gòu)特征分析
三、扇貝基因家族分析及比較基因組分析
四、扇貝胚胎發(fā)育基因表達模式
五、扇貝特殊適應(yīng)性性狀的遺傳基礎(chǔ)、調(diào)控機制及進化途徑分析
第十三節(jié) 馬氏珠母貝
一、簡介
二、馬氏珠母貝基因組的研究
三、以基因組為基礎(chǔ)的功能基因研究
第十四節(jié) 鮑
一、物種簡介
二、鮑功能基因研究進展
三、鮑轉(zhuǎn)基因技術(shù)的初步研究
四、展望
第十五節(jié) 芋螺
一、簡介
二、基因組及功能基因研究進展
三、芋螺毒素功能基因發(fā)掘利用
第十六節(jié) 芋螺轉(zhuǎn)錄組與芋螺毒素基因庫建設(shè)
一、芋螺基因組調(diào)查測序分析
二、多種芋螺轉(zhuǎn)錄組測序分析
主要參考文獻
第五章 海洋植物功能基因的發(fā)掘和利用
第一節(jié) 海洋植物基因組及功能基因研究進展
一、我國紅藻栽培及分子生物學(xué)研究現(xiàn)狀
二、我國綠潮原因種——滸苔及功能基因研究現(xiàn)狀
三、我國褐藻栽培及分子生物學(xué)研究狀況
四、海洋微藻的研究與利用
五、總結(jié)與展望
第二節(jié) 褐藻
一、簡介
二、基因組及功能基因研究進展
三、功能基因發(fā)掘利用
第三節(jié) 紫菜
一、簡介
二、基因組及功能基因研究進展
三、紫菜功能基因相關(guān)研究及發(fā)掘利用
第四節(jié) 江蘺
一、簡介
二、基因組及功能基因研究進展
三、功能基因發(fā)掘利用
第五節(jié) 微藻
一、簡介
二、基因組及功能基因研究進展
三、微藻功能基因的利用
主要參考文獻
第六章 海洋微生物功能基因的發(fā)掘和利用
第一節(jié) 對蝦白斑綜合征病毒
一、WSSV基因組研究
二、WSSV結(jié)構(gòu)蛋白研究
三、WSSV極早期基因研究
第二節(jié) 遲緩愛德華菌
一、遲緩愛德華菌簡介
二、遲緩愛德華菌基因組
三、遲緩愛德華菌基因功能研究
四、基于遲緩愛德華菌毒力功能基因的相關(guān)疫苗設(shè)計
第三節(jié) 其他海洋微生物
一、簡介
二、基因組及功能基因研究進展
三、功能基因發(fā)掘利用
第四節(jié) 極端環(huán)境微生物
一、簡介
二、基因組及功能基因研究進展
三、功能基因發(fā)掘利用
主要參考文獻
第七章 其他海洋生物功能基因的發(fā)掘和利用
第一節(jié) 單環(huán)刺蜢
一、種類概況簡介
二、基因組及功能基因研究進展
三、功能基因應(yīng)用研究
第二節(jié) 綠海龜
一、綠海龜和中華鱉簡介
二、綠海龜和中華鱉基因組的測序及組裝
三、結(jié)果與分析
四、總結(jié)
第三節(jié) 小須鯨
一、物種簡介
二、基因組工作
三、重要功能基因
主要參考文獻
第八章 海洋生物基因資源共享及數(shù)據(jù)庫建設(shè)
第一節(jié) 海洋生物基因資源共享辦法
一、總則
二、共享海洋生物基因數(shù)據(jù)資源的保存原則及方式
三、海洋生物基因資源共享原則及方式
四、海洋生物基因資源保存及共享各方責(zé)權(quán)
五、管理機構(gòu)及職能
第二節(jié) 千種魚類轉(zhuǎn)錄組計劃
第三節(jié) 國際水生哺乳動物基因組計劃
第四節(jié) 深圳國家基因庫的數(shù)據(jù)庫建設(shè)與應(yīng)用
一、簡介
二、國家基因庫數(shù)據(jù)庫建設(shè)
三、國家基因庫數(shù)據(jù)庫應(yīng)用實例
四、生物信息數(shù)據(jù)庫建設(shè)的探討
主要參考文獻