數(shù)量性狀遺傳分析

前言
第1章 數(shù)量性狀遺傳研究基礎
1．1 遺傳學基礎及其發(fā)展
1．1．1 質量性狀遺傳與經典遺傳學的發(fā)展
1．1．2 數(shù)量性狀遺傳與數(shù)量遺傳學的發(fā)展
1．1．3 DNA標記與現(xiàn)代數(shù)量遺傳學
1．1．4 數(shù)量遺傳學在我國的發(fā)展
1．2 群體遺傳學基礎及其發(fā)展
1．2．1 孟德爾群體遺傳結構的數(shù)學模型
1．2．2 隨機交配下理想大孟德爾群體的平衡
1．2．3 群體在非隨機交配下的遺傳效應
1．2．4 改變群體基因頻率的因素
1．3 統(tǒng)計學基礎
1．3．1．正態(tài)分布及其參數(shù)估計
1．3．2 有限混合正態(tài)分布及其參數(shù)估計
1．3．3 線性統(tǒng)計模型基礎
第2章 近交與隨機交配群體的遺傳分析
2．1．基因型與環(huán)境
2．1．1 表現(xiàn)型值與基因型值
2．1．2 基因型與環(huán)境互作的方差分析
2．2 基因型值分解、基因的平均效應和育種值
2．2．1 基因型值的分解
2．2．2 平衡群體中基因的效應
2．2．3 平衡群體中個體的育種值和育種效應
2．2．4 育種值和基因型值的關系
2．3 近交群體數(shù)量性狀的世代均數(shù)分析
2．3．1 世代平均數(shù)的遺傳組成(期望組分)
2．3．2 遺傳參數(shù)估計與遺傳模型檢驗
2．4 近交群體數(shù)量性狀的世代方差分析
2．4．1 不分離世代的方差
2．4．2 分離世代集團混種(混養(yǎng))的方差剖分
2．4．3 F1 代連續(xù)自交的分支交配系統(tǒng)方差的逐級分解
2．4．4 S3、S4世代方差的分解
2．4．5 顯性度
2．4．6 自交選擇的*適世代及分離極限估計
2．5 連鎖對世代均數(shù)和方差的影響
2．5．1 加性-顯性遺傳模型下的兩對與多對基因連鎖的F2 代遺傳分析
2．5．2 連鎖對F1 代連續(xù)自交的分支交配系統(tǒng)方差的影響
2．5．3 連鎖不平衡群體
2．6 隨機交配群體中親屬間的相關與回歸
2．6．1 隨機交配平衡群體中親屬遺傳協(xié)方差及其相似性
2．6．2 近親交配群體的近交系數(shù)計算
2．6．3 親屬協(xié)方差的一般形式
2．6．4 常見親屬協(xié)方差組分中U和r的計算
第3章 重復力、遺傳力、相關及其估計
3．1 重復力、遺傳力和相關的概念
3．1．1 遺傳力(率)和重復力(率)
3．1．2 表型相關、遺傳相關和環(huán)境相關
3．1．．3 親屬問的表型相似性
3．2 重復力、廣義遺傳力估計及重復力的應用
3．2．1 單因素遺傳設計試驗的組內相關估計方法
3．2．2 重復力的準確度及其應用
3．3 狹義遺傳力的估計
3．3．1 用雙親本雜交類型遺傳設計估計遺傳力
3．3．2 用NCI遺傳設計試驗估計狹義遺傳力
3．3．3 用NCII遺傳設計試驗估計狹義遺傳力
3．3．4 用NCIII遺傳設計估計狹義遺傳力
3．4 多個數(shù)量性狀的遺傳力和相關估計
3．4．1 單因素遺傳設計完全隨機區(qū)組試驗估計方法
3．4．2 NCI遺傳設計完全隨機試驗的多性狀遺傳力和相關估計
3．5 閾性狀及其重復力、遺傳力的估計
3．5．1 閾性狀的重復力估計
3．5．2 閾性狀的遺傳力估計
3．6 遺傳力、重復力顯著性測驗原理
3．6．1．均方的方差估計
3．6．2 均方比的方差估計
3．6．3 常用遺傳設計試驗中組內相關系數(shù)的假設檢驗
第4章 選擇原理、方法和模型
4．1．選擇的基本原理
4．1．1 選擇及其預期選擇反應
4．1．2 選擇極限與世代選擇效率指數(shù)
4．1．3 世代間隔、單位時間遺傳進展與現(xiàn)實遺傳力
4．2 單性狀選擇方法
4．2．1 個體選擇
4．2．2 家系選擇與同胞選擇
4．2．3 家系內選擇
4．2．4 合并選擇
4．2．5 幾種選擇方法相對效率比較
4．3 間接選擇和綜合選擇指數(shù)
4．3．1 間接選擇
4．3．2 多性狀的選擇．綜合選擇指數(shù)
4．3．3 選擇指數(shù)的通徑分析和決策分析
4．3．4 相關遺傳進展分解原理與決定系數(shù)遺傳力
4．4 通用選擇指數(shù)
4．4．1 通用選擇指數(shù)
4．4．2 通用選擇指數(shù)的通徑分析和決策分析
4．5 組合性狀與組合性狀對分析
4．5．1 約束組合性狀分析
4．5．2 約束組合性狀對分析及其通徑分析、決策分析
第5章 主基因．多基因遺傳體系分析
5．1 單個分離世代數(shù)量性狀的分離分析
5．1．1 單個分離世代表型分布的主要特征
5．1．2 F2 代數(shù)量性狀分離分析模型
5．1．3 回交世代的主基因．多基因混合遺傳分離分析模型
5．1．4 單個分離世代數(shù)量性狀分離分析的一步法和兩步法
5．2 數(shù)量性狀的多世代聯(lián)合分離分析簡介
5．3 主基因．多基因數(shù)量性狀的綜合選擇指數(shù)
5．3．1 綜合選擇指數(shù)原理
5．3．2 應用舉例
第6章 交配效應與配合力分析
6．1 交配效應分析
6．1．1 近交衰退
6．1．2 近交導致的群體遺傳方差再分配
6．1．3 雜種優(yōu)勢
6．1．4 雜交引起的群體遺傳方差再分配
6．1．5 近交、雜交與環(huán)境方差
6．1．6 雜種優(yōu)勢的機理
6．2 配合力分析
6．2．1 配合力概念及其方差
6．2．2 配合力估計的試驗設計方法
6．2．3 雙列雜交完全隨機區(qū)組試驗的配合力分析
6．2．4 關于多元雙列雜交的配合力分析
第7章 數(shù)量性狀與分子遺傳學
7．1．數(shù)量性狀與遺傳學
7．1．1 數(shù)量性狀與經典遺傳學
7．1．2 數(shù)量性狀與分子遺傳學
7．1．3 遺傳標記與基因定位
7．2 QTL的初級定位及其作圖原理
7．2．1 作圖群體的建立
7．2．2 圖譜構建的理論基礎
7．3 單標記分析法
7．3．1 單標計分析樣本資料表
7．3．2 用重組率，表示的標記和QTL基因型頻率表
7．3．3 基于標記分組的標記和QTL的共分離信息
7．3．4 均值差．方差分析法及參數(shù)估計
7．3．5 最大似然估計的EM算法
7．4 區(qū)間作圖法和復合區(qū)間作圖法
7．4．1 區(qū)間作圖法
7．4．2 復合區(qū)間作圖法
7．5 數(shù)量性狀的標記輔助選擇
7．5．1 標記值選擇
7．5．2 指數(shù)選擇
7．5．3 數(shù)量性狀的分子標記輔助選擇
7．6 KEGG通路的通徑分析及其決策分析
7．6．1 DIA方法的KEGG通路
7．6．2 KEGG通路DIA影響的通徑分析及其決策分析
7．6．3 細胞過程路梯度分析、通徑分析及其決策分析
7．6．4 梯度分析、通徑分析及其決策分析與DIA方法的比較
參考文獻