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內容簡介

　　《生物大分子的數學描述及其應用》是在編者實際從事的課題基礎上形成的，從這個意義上講，《生物大分子的數學描述及其應用》可以說是一份工作匯報。建立生物學數據以及各種數據間復雜關系的數學模型，然后在此基礎上分析和解釋相應生物學意義，進而探索其固有的生物學規(guī)律并研究相關生物信息學問題，這是《生物大分子的數學描述及其應用》的特色之處。《生物大分子的數學描述及其應用》主要內容包括生物大分子的圖形表示；生物序列的數值刻畫；序列與結構的粗?；枋?；蛋白質編碼基因識別等。

作者簡介

　　李春，渤海大學數學系副教授。2006年畢業(yè)于大連理工大學應用數學系計算數學專業(yè)，獲理學博士學位?，F為遼寧省第四批“百千萬人才工程”千人層次人選，應用數學遼寧省重點掌科帶頭人，遼寧省普通高等學校優(yōu)秀青年骨干教師，錦州市酋批市級后備學術和技術帶頭人。渤海大學學術帶頭人。近年來主要從事組合數掌和生物信息學的教學和科研工作。主持和參與完成國r永自然科學基金項目和遼寧省教育廳項目五項。已出版教材一部，發(fā)表論文三十余篇。錢偉懿，渤海大學數學系教授。2004年畢業(yè)于大連理工大掌應用數學系運籌學與控制論專業(yè)：獲理學博士學位。現為遼寧省數學與應用數學示范專業(yè)帶頭人，應用數學遼寧省重點學科負責人，近年來主要從事最優(yōu)化理論及應用、生物信息掌中的優(yōu)化問題研究。主持和參加國家自然科學基金項目、遼寧省教育廳項目七項。已出版專著一部，教材一部，發(fā)表論文四十余篇。

圖書目錄

第0章緒論
0.1 生物信息學產生的背景
0.2 生物信息學的研究對象
0.2.1 核酸
0.2.2 蛋白質
0.2.3 中心法則和遺傳密碼
0.3 生物信息學的主要研究內容
0.3.1 序列比較
0.3.2 計算機輔助基因識別
0.3.3 系統(tǒng)發(fā)育分析
0.3.4 RNA和蛋白質的結構研究
0.4 本書的主要內容
參考文獻
第1章生物大分子的圖形表示
1.1 引言
1.1.1 DNA序列的圖形表示
1.1.2 RNA二級結構的圖形表示
1.1.3 蛋白質序列的圖形表示
1.2 DNA序列的3－D圖形表示
1.3 DNA序列的2－D圖形表
1.3.1 特征序列
1.3.2 基于特征序列的“雙水平線”圖
1.3.3 基于特征序列的“梯狀”圖
1.4 有向圖表示
參考文獻
第2章生物序列的數值刻畫
2.1 引言
2.2 偽跡
2.3 ALE－指標
2.3.1 ALE－指標
2.3.2 性質
2.3.3 應用
2.4 上三角矩陣表示
2.4.1 序列不變量的相容性
2.4.2 有向圖及上三角矩陣的應用
2.5 正規(guī)化相對熵
2.5.1 定義
2.5.2 應用
參考文獻0
第3章序列與結構的粗粒化描述
3.1 DNA序列的邏輯表示
3.1.1 邏輯表示同其他表示的比較8
3.1.2 邏輯序列的SS矩陣及其壓縮矩陣
3.2 蛋白質序列的邏輯表示
3.2.1 蛋白質序列的邏輯表
3.2.2 應用
3.3 基于5字母模型的蛋白質序列的圖形表示及應用
3.3.1 氨基酸的5－字母模型
3.3.2 蛋白質序列的2－D圖形表
3.3.3 蛋白質序列的數值刻畫
3.3.4 冠狀病毒的系統(tǒng)發(fā)育分析
3.4 LZ復雜度及應用
3.4.1 有限序列的LZ復雜度
3.4.2 基于LZ復雜度的RNA二級結構相似性分析
3.4.3 廣義LZ復雜度及應用
參考文獻
第4章蛋白質編碼基因識別
4.1 引言
4.2 DNA序列基于正規(guī)化相對熵的數值刻畫
4.3 Fisher線性判別法
4.4 算法的評估
4.4.1 敏感度、特異性和準確度的定義
4.4.2 算法的評估
4.5 識別釀酒酵母基因組2－6類中的基因
參考文獻
結語