基因表達分析手冊：方法的實用性及其缺陷

上卷
第1章 基因表達的基本概念
　 1.1 引言
　 1.2 細胞內(nèi)的轉(zhuǎn)錄與翻譯
　 1.2.1 概述
　 1.2.2 轉(zhuǎn)錄
　 1.2.3 翻譯
　 1.2.4 小結(jié)
　 1.3 轉(zhuǎn)錄調(diào)控
　 1.3.1 概述
　 1.3.2 mRNA表達譜——轉(zhuǎn)錄組（transcriptome）
　 1.3.3 蛋白質(zhì)表達譜——蛋白質(zhì)組（proteome）
　 1.3.4 基因和蛋白質(zhì)的相互作用——互作組（interactome）
　 1.3.5 轉(zhuǎn)錄裝置與核心啟動子
　 1.3.6 調(diào)節(jié)啟動子
　 1.3.7 增強子
　 1.3.8 基因座控制區(qū)
　 1.3.9 基質(zhì)附著區(qū)
　 1.3.10 隔絕子
　 1.3.11 RIDGE曾強的基因表達區(qū)
　 1.3.12 增強子體
　 1.3.13 染色質(zhì)
　 1.3.14 沉默子元件
　 1.3.15 轉(zhuǎn)錄因子、阻遏因子和輔助阻遏因子
　 1.3.16 表觀遺傳學
　 1.3.17 概括和總結(jié)
　 1.4 轉(zhuǎn)錄后調(diào)控
　 1.4.1 概述
　 1.4.2 RNA穩(wěn)定性和降解的調(diào)控
　 1.4.3 轉(zhuǎn)錄延伸的調(diào)控
　 1.4.4 前體mRNA的差別/可變剪接
　 1.4.5 反式RNA剪接
　 1.4.6 mRNA轉(zhuǎn)運的調(diào)控
　 1.4.7 定向的細胞 mRNA定位
　 1.4.8 mRNA聚腺苷酸化的調(diào)控
　 1.4.9 反式RNA
　 1.4.10 RNA編輯
　 1.4.11 小結(jié)
　 1.5 蛋白質(zhì)的翻譯后修飾
　 1.5.1 概述
　 1.5.2 蛋白質(zhì)的酶促剪切
　 1.5.3 乙酰化
　 1.5.4 （聚）異戊二烯基化
　 1.5.5 甲基化
　 1.5.6 硫酸化
　 1.5.7 磷酸化
　 1.5.8 泛素化
　 1.5.9 糖基化
　 1.5.10 小結(jié)
　 1.6 mRNA與蛋白質(zhì)表達的相關(guān)性
　 1.6.1 概述
　 1.6.2 mRNA水平和蛋白質(zhì)的表達：相關(guān)性和差異性
　 1.6.3 小結(jié)
　 1.7 持家基因及內(nèi)部和外部的標準
　 1.7.1 什么是持家基因
　 1.7.2 重要持家基因概述
　 1.7.3 其他常用的持家基因
　 1.7.4 新確定的維持基因
　 1.7.5 定量方法
　 1.7.6 小結(jié)
　 1.8 不同基因表達技術(shù)的分類
　 1.8.1 概述
　 1.8.2 從單個基因到轉(zhuǎn)錄組
　 1.8.3 分類的方法
　 1.8.4 小結(jié)
　 1.9 總結(jié)
　 1.10 參考文獻

第2章 樣品制備與輔助工具
　　2.1　引言
　　2.2　細胞和組織的制備
　　　2.2.1　免疫法純化細胞
　　　2.2.2　差速離心/反向洗脫
　　　2.2.3　表面親和層析
　　　2.2.4　密度梯度離心
　　　2.2.5　流式細胞術(shù)
　　　2.2.6　組織微分離技術(shù)
　　　2.2.7　各種細胞的分離和培養(yǎng)技術(shù)
　　2.3　核酸和蛋白質(zhì)的制備
　　　2.3.1　概述
　　　2.3.2　總RNA和mRNA的分離
　　　2.3.3　分離前RNA的穩(wěn)定性
　　　2.3.4　從培養(yǎng)的細胞和組織中制備蛋白質(zhì)樣品
　　2.4　總結(jié)
　　2.5　參考文獻

第3章 mRNA表達的分析方法

下卷
　第4章 mRNA表達的高通量分析方法
　第5章 蛋白質(zhì)表達分析
　第6章 原位和體內(nèi)的mRNA及蛋白質(zhì)表達分析方法
　第7章 計算方法和生物信息學工具